Protein–RNA interactions for Protein: Q06710

PAX8, Paired box protein Pax-8, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX8Q06710 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
PAX8Q06710 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
PAX8Q06710 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
PAX8Q06710 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
PAX8Q06710 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PAX8Q06710 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
PAX8Q06710 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
PAX8Q06710 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PAX8Q06710 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
PAX8Q06710 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
PAX8Q06710 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
PAX8Q06710 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
PAX8Q06710 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
PAX8Q06710 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
PAX8Q06710 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
PAX8Q06710 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PAX8Q06710 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PAX8Q06710 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PAX8Q06710 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PAX8Q06710 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
PAX8Q06710 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
PAX8Q06710 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PAX8Q06710 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
PAX8Q06710 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
PAX8Q06710 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PAX8Q06710 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PAX8Q06710 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PAX8Q06710 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
PAX8Q06710 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PAX8Q06710 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
PAX8Q06710 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PAX8Q06710 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PAX8Q06710 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
PAX8Q06710 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PAX8Q06710 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PAX8Q06710 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PAX8Q06710 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PAX8Q06710 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PAX8Q06710 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PAX8Q06710 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
PAX8Q06710 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PAX8Q06710 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PAX8Q06710 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
PAX8Q06710 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
PAX8Q06710 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PAX8Q06710 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PAX8Q06710 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PAX8Q06710 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PAX8Q06710 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC12.47□□□□□ -0.41
PAX8Q06710 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
PAX8Q06710 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC12.47□□□□□ -0.41
PAX8Q06710 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC12.47□□□□□ -0.41
PAX8Q06710 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
PAX8Q06710 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
PAX8Q06710 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PAX8Q06710 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
PAX8Q06710 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
PAX8Q06710 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
PAX8Q06710 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
PAX8Q06710 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC12.47□□□□□ -0.41
PAX8Q06710 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PAX8Q06710 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
PAX8Q06710 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
PAX8Q06710 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
PAX8Q06710 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
PAX8Q06710 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
PAX8Q06710 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
PAX8Q06710 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PAX8Q06710 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC12.47□□□□□ -0.41
PAX8Q06710 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
PAX8Q06710 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
PAX8Q06710 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
PAX8Q06710 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
PAX8Q06710 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PAX8Q06710 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
PAX8Q06710 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PAX8Q06710 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PAX8Q06710 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
PAX8Q06710 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PAX8Q06710 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PAX8Q06710 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PAX8Q06710 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PAX8Q06710 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PAX8Q06710 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PAX8Q06710 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
PAX8Q06710 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PAX8Q06710 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PAX8Q06710 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PAX8Q06710 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PAX8Q06710 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PAX8Q06710 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PAX8Q06710 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PAX8Q06710 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
PAX8Q06710 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
PAX8Q06710 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC12.46□□□□□ -0.41
PAX8Q06710 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
PAX8Q06710 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
PAX8Q06710 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
PAX8Q06710 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
PAX8Q06710 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms