Protein–RNA interactions for Protein: Q06609

RAD51, DNA repair protein RAD51 homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD51Q06609 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAD51Q06609 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAD51Q06609 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAD51Q06609 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAD51Q06609 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
RAD51Q06609 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAD51Q06609 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAD51Q06609 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAD51Q06609 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
RAD51Q06609 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAD51Q06609 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAD51Q06609 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAD51Q06609 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAD51Q06609 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAD51Q06609 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAD51Q06609 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAD51Q06609 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAD51Q06609 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAD51Q06609 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAD51Q06609 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAD51Q06609 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
RAD51Q06609 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAD51Q06609 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAD51Q06609 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAD51Q06609 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAD51Q06609 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAD51Q06609 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAD51Q06609 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAD51Q06609 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAD51Q06609 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAD51Q06609 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAD51Q06609 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAD51Q06609 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAD51Q06609 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAD51Q06609 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAD51Q06609 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAD51Q06609 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAD51Q06609 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAD51Q06609 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAD51Q06609 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAD51Q06609 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAD51Q06609 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAD51Q06609 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAD51Q06609 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAD51Q06609 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAD51Q06609 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAD51Q06609 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAD51Q06609 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAD51Q06609 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAD51Q06609 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAD51Q06609 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAD51Q06609 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAD51Q06609 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAD51Q06609 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAD51Q06609 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAD51Q06609 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAD51Q06609 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAD51Q06609 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAD51Q06609 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAD51Q06609 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAD51Q06609 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAD51Q06609 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAD51Q06609 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAD51Q06609 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
RAD51Q06609 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAD51Q06609 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAD51Q06609 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAD51Q06609 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAD51Q06609 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAD51Q06609 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAD51Q06609 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAD51Q06609 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAD51Q06609 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAD51Q06609 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAD51Q06609 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAD51Q06609 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAD51Q06609 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAD51Q06609 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
RAD51Q06609 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAD51Q06609 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAD51Q06609 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAD51Q06609 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAD51Q06609 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAD51Q06609 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAD51Q06609 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAD51Q06609 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAD51Q06609 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
RAD51Q06609 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAD51Q06609 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
RAD51Q06609 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAD51Q06609 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAD51Q06609 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
RAD51Q06609 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAD51Q06609 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAD51Q06609 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAD51Q06609 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAD51Q06609 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAD51Q06609 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAD51Q06609 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAD51Q06609 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.1 ms