Protein–RNA interactions for Protein: Q06547

GABPB1, GA-binding protein subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPB1Q06547 CCNC-210ENST00000520429 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABPB1Q06547 CSF3R-201ENST00000331941 2375 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABPB1Q06547 AGAP6-202ENST00000412531 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABPB1Q06547 ENOX1-201ENST00000261488 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABPB1Q06547 FHOD3-206ENST00000590592 4869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABPB1Q06547 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABPB1Q06547 RAPH1-202ENST00000319170 9808 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABPB1Q06547 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABPB1Q06547 ADCY4-202ENST00000418030 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABPB1Q06547 MYOM3-202ENST00000374434 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABPB1Q06547 AMER2-201ENST00000357816 10055 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABPB1Q06547 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABPB1Q06547 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABPB1Q06547 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
GABPB1Q06547 TRMT61A-202ENST00000389749 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABPB1Q06547 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABPB1Q06547 WTH3DI-201ENST00000623617 3032 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABPB1Q06547 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABPB1Q06547 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABPB1Q06547 ACAN-209ENST00000617301 8669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABPB1Q06547 FRMD1-205ENST00000440994 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABPB1Q06547 AL390066.1-201ENST00000456414 2302 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABPB1Q06547 MIR193BHG-211ENST00000641433 5365 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
GABPB1Q06547 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABPB1Q06547 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABPB1Q06547 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABPB1Q06547 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABPB1Q06547 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABPB1Q06547 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABPB1Q06547 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
GABPB1Q06547 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABPB1Q06547 MKL1-211ENST00000618196 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABPB1Q06547 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABPB1Q06547 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABPB1Q06547 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABPB1Q06547 CSNK1E-201ENST00000359867 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABPB1Q06547 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABPB1Q06547 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABPB1Q06547 COG6-202ENST00000416691 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABPB1Q06547 ASCC3-203ENST00000369143 3433 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABPB1Q06547 RRBP1-206ENST00000455029 2485 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABPB1Q06547 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABPB1Q06547 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABPB1Q06547 PITX2-211ENST00000613094 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABPB1Q06547 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABPB1Q06547 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
GABPB1Q06547 DLGAP3-201ENST00000235180 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GABPB1Q06547 NOTCH1-201ENST00000277541 9371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GABPB1Q06547 UBFD1-207ENST00000567212 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GABPB1Q06547 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GABPB1Q06547 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GABPB1Q06547 YWHAQ-202ENST00000381844 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GABPB1Q06547 COL1A2-213ENST00000620463 4523 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GABPB1Q06547 GABRB3-219ENST00000636466 4509 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GABPB1Q06547 DPYSL2-204ENST00000521913 4805 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GABPB1Q06547 KRT42P-202ENST00000438131 2895 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GABPB1Q06547 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GABPB1Q06547 AL008727.1-201ENST00000564460 4728 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GABPB1Q06547 IKBKB-218ENST00000520835 2403 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GABPB1Q06547 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GABPB1Q06547 TNK1-201ENST00000570896 3122 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GABPB1Q06547 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GABPB1Q06547 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GABPB1Q06547 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GABPB1Q06547 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GABPB1Q06547 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GABPB1Q06547 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GABPB1Q06547 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
GABPB1Q06547 MALL-201ENST00000272462 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GABPB1Q06547 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GABPB1Q06547 MKNK1-201ENST00000341183 2612 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GABPB1Q06547 LINC02015-202ENST00000436078 2957 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GABPB1Q06547 FAM86JP-201ENST00000467239 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GABPB1Q06547 PPIP5K1-209ENST00000420765 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GABPB1Q06547 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GABPB1Q06547 NFKBIZ-202ENST00000326172 3923 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GABPB1Q06547 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GABPB1Q06547 SLC5A5-201ENST00000222248 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GABPB1Q06547 DNAJA4-203ENST00000394855 3245 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GABPB1Q06547 RSBN1-204ENST00000612242 6592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GABPB1Q06547 PTPRH-202ENST00000376350 3877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GABPB1Q06547 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GABPB1Q06547 AL359915.2-202ENST00000440150 2469 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GABPB1Q06547 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GABPB1Q06547 FAM212B-AS1-201ENST00000430373 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GABPB1Q06547 REXO5-208ENST00000564274 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GABPB1Q06547 TVP23A-201ENST00000299866 3360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GABPB1Q06547 SOAT1-204ENST00000540564 6861 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GABPB1Q06547 IMMT-204ENST00000410111 3001 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GABPB1Q06547 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABPB1Q06547 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABPB1Q06547 OCRL-202ENST00000371113 5162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABPB1Q06547 GRM1-202ENST00000355289 3874 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABPB1Q06547 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABPB1Q06547 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABPB1Q06547 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABPB1Q06547 NTNG1-204ENST00000370067 4628 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABPB1Q06547 CT62-203ENST00000566432 2822 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABPB1Q06547 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABPB1Q06547 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms