Protein–RNA interactions for Protein: Q02818

NUCB1, Nucleobindin-1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUCB1Q02818 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NUCB1Q02818 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NUCB1Q02818 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
NUCB1Q02818 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NUCB1Q02818 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NUCB1Q02818 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NUCB1Q02818 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NUCB1Q02818 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NUCB1Q02818 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NUCB1Q02818 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NUCB1Q02818 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NUCB1Q02818 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NUCB1Q02818 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NUCB1Q02818 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
NUCB1Q02818 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NUCB1Q02818 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NUCB1Q02818 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
NUCB1Q02818 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
NUCB1Q02818 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
NUCB1Q02818 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
NUCB1Q02818 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NUCB1Q02818 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NUCB1Q02818 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NUCB1Q02818 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NUCB1Q02818 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
NUCB1Q02818 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NUCB1Q02818 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NUCB1Q02818 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
NUCB1Q02818 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NUCB1Q02818 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NUCB1Q02818 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NUCB1Q02818 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NUCB1Q02818 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NUCB1Q02818 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NUCB1Q02818 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NUCB1Q02818 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NUCB1Q02818 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NUCB1Q02818 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NUCB1Q02818 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NUCB1Q02818 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NUCB1Q02818 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
NUCB1Q02818 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NUCB1Q02818 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NUCB1Q02818 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NUCB1Q02818 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NUCB1Q02818 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NUCB1Q02818 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
NUCB1Q02818 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NUCB1Q02818 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NUCB1Q02818 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
NUCB1Q02818 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
NUCB1Q02818 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NUCB1Q02818 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NUCB1Q02818 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
NUCB1Q02818 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NUCB1Q02818 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NUCB1Q02818 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NUCB1Q02818 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NUCB1Q02818 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NUCB1Q02818 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NUCB1Q02818 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NUCB1Q02818 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NUCB1Q02818 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NUCB1Q02818 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NUCB1Q02818 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NUCB1Q02818 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NUCB1Q02818 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NUCB1Q02818 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NUCB1Q02818 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NUCB1Q02818 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC18.71■□□□□ 0.58
NUCB1Q02818 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NUCB1Q02818 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NUCB1Q02818 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NUCB1Q02818 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NUCB1Q02818 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NUCB1Q02818 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NUCB1Q02818 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NUCB1Q02818 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NUCB1Q02818 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NUCB1Q02818 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NUCB1Q02818 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NUCB1Q02818 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NUCB1Q02818 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
NUCB1Q02818 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NUCB1Q02818 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
NUCB1Q02818 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NUCB1Q02818 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NUCB1Q02818 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NUCB1Q02818 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NUCB1Q02818 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NUCB1Q02818 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NUCB1Q02818 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NUCB1Q02818 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NUCB1Q02818 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NUCB1Q02818 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
NUCB1Q02818 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NUCB1Q02818 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NUCB1Q02818 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
NUCB1Q02818 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NUCB1Q02818 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms