Protein–RNA interactions for Protein: Q02577

NHLH2, Helix-loop-helix protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLH2Q02577 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
NHLH2Q02577 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
NHLH2Q02577 PPP6R2-202ENST00000359139 4035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
NHLH2Q02577 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
NHLH2Q02577 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
NHLH2Q02577 PLCB1-218ENST00000629992 3095 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
NHLH2Q02577 MMAB-210ENST00000545712 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
NHLH2Q02577 ENO2-214ENST00000545045 1911 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
NHLH2Q02577 RIOK1-202ENST00000379834 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
NHLH2Q02577 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
NHLH2Q02577 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
NHLH2Q02577 FAM13B-201ENST00000033079 5465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
NHLH2Q02577 USP48-213ENST00000529637 3228 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
NHLH2Q02577 CALML3-201ENST00000315238 2763 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
NHLH2Q02577 C8orf31-201ENST00000395172 1875 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
NHLH2Q02577 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
NHLH2Q02577 PSME3-203ENST00000541124 3366 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
NHLH2Q02577 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
NHLH2Q02577 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
NHLH2Q02577 KIFC3-202ENST00000421376 3128 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
NHLH2Q02577 AC130686.1-201ENST00000622936 2466 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
NHLH2Q02577 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
NHLH2Q02577 FUK-202ENST00000378912 3925 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
NHLH2Q02577 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
NHLH2Q02577 MAPRE2-201ENST00000300249 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
NHLH2Q02577 TRIM25-201ENST00000316881 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
NHLH2Q02577 ELN-210ENST00000380584 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
NHLH2Q02577 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
NHLH2Q02577 TNFAIP8L1-201ENST00000327473 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
NHLH2Q02577 TNFAIP8L1-202ENST00000536716 3845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
NHLH2Q02577 FUT3-201ENST00000303225 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
NHLH2Q02577 FEM1A-201ENST00000269856 9593 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
NHLH2Q02577 DLGAP1-204ENST00000400149 5203 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
NHLH2Q02577 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
NHLH2Q02577 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
NHLH2Q02577 KCTD7-201ENST00000275532 4795 ntTSL 4 BASIC12.43□□□□□ -0.42
NHLH2Q02577 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
NHLH2Q02577 MGC16275-201ENST00000499670 2501 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
NHLH2Q02577 AL356275.1-201ENST00000638446 7440 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
NHLH2Q02577 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
NHLH2Q02577 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
NHLH2Q02577 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
NHLH2Q02577 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
NHLH2Q02577 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
NHLH2Q02577 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
NHLH2Q02577 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
NHLH2Q02577 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
NHLH2Q02577 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
NHLH2Q02577 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
NHLH2Q02577 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
NHLH2Q02577 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
NHLH2Q02577 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
NHLH2Q02577 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
NHLH2Q02577 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
NHLH2Q02577 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
NHLH2Q02577 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
NHLH2Q02577 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
NHLH2Q02577 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
NHLH2Q02577 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
NHLH2Q02577 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
NHLH2Q02577 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
NHLH2Q02577 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
NHLH2Q02577 AC092634.8-201ENST00000639687 773 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
NHLH2Q02577 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
NHLH2Q02577 PRRT2-201ENST00000300797 3002 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
NHLH2Q02577 NDUFS7-202ENST00000313408 2818 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
NHLH2Q02577 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
NHLH2Q02577 MAPKAPK5-206ENST00000550735 11349 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
NHLH2Q02577 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
NHLH2Q02577 KIRREL3-205ENST00000529097 3397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
NHLH2Q02577 SLC22A12-202ENST00000377567 2599 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
NHLH2Q02577 SNAP91-215ENST00000521743 4263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
NHLH2Q02577 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
NHLH2Q02577 TET3-201ENST00000305799 5174 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
NHLH2Q02577 TOLLIP-202ENST00000317204 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
NHLH2Q02577 ITGB3-201ENST00000559488 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
NHLH2Q02577 FAM129B-202ENST00000373314 3760 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
NHLH2Q02577 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
NHLH2Q02577 PRSS16-203ENST00000421826 1949 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
NHLH2Q02577 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
NHLH2Q02577 GNAL-203ENST00000423027 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
NHLH2Q02577 PELP1-202ENST00000436683 3524 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
NHLH2Q02577 TRIM10-204ENST00000449742 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
NHLH2Q02577 RIC8B-202ENST00000392837 5135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
NHLH2Q02577 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
NHLH2Q02577 CEP131-201ENST00000269392 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
NHLH2Q02577 ADAM33-201ENST00000350009 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
NHLH2Q02577 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC12.42□□□□□ -0.42
NHLH2Q02577 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
NHLH2Q02577 TOE1-201ENST00000372090 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
NHLH2Q02577 SF1-201ENST00000227503 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
NHLH2Q02577 MCHR1-201ENST00000249016 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
NHLH2Q02577 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
NHLH2Q02577 ESPN-201ENST00000377828 3531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
NHLH2Q02577 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
NHLH2Q02577 ADCY3-202ENST00000405392 4397 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
NHLH2Q02577 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
NHLH2Q02577 SLC4A5-201ENST00000346834 6233 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
NHLH2Q02577 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
NHLH2Q02577 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.1 ms