Protein–RNA interactions for Protein: Q01892

SPIB, Transcription factor Spi-B, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIBQ01892 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
SPIBQ01892 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
SPIBQ01892 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SPIBQ01892 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SPIBQ01892 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SPIBQ01892 C4B-201ENST00000425700 5237 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SPIBQ01892 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SPIBQ01892 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SPIBQ01892 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SPIBQ01892 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SPIBQ01892 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SPIBQ01892 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SPIBQ01892 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SPIBQ01892 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SPIBQ01892 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SPIBQ01892 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SPIBQ01892 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SPIBQ01892 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SPIBQ01892 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SPIBQ01892 SLC12A5-211ENST00000616933 6166 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SPIBQ01892 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SPIBQ01892 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SPIBQ01892 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SPIBQ01892 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SPIBQ01892 SBF1-202ENST00000380817 8008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SPIBQ01892 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SPIBQ01892 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SPIBQ01892 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SPIBQ01892 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SPIBQ01892 BVES-201ENST00000314641 5567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SPIBQ01892 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SPIBQ01892 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SPIBQ01892 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SPIBQ01892 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SPIBQ01892 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SPIBQ01892 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SPIBQ01892 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SPIBQ01892 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SPIBQ01892 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SPIBQ01892 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SPIBQ01892 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SPIBQ01892 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SPIBQ01892 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SPIBQ01892 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
SPIBQ01892 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SPIBQ01892 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SPIBQ01892 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
SPIBQ01892 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SPIBQ01892 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
SPIBQ01892 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SPIBQ01892 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SPIBQ01892 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SPIBQ01892 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SPIBQ01892 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SPIBQ01892 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
SPIBQ01892 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SPIBQ01892 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SPIBQ01892 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SPIBQ01892 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SPIBQ01892 RSBN1-201ENST00000261441 6621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SPIBQ01892 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SPIBQ01892 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SPIBQ01892 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SPIBQ01892 KIRREL1-204ENST00000368173 7519 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SPIBQ01892 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SPIBQ01892 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SPIBQ01892 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SPIBQ01892 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SPIBQ01892 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SPIBQ01892 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SPIBQ01892 DTX3L-201ENST00000296161 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SPIBQ01892 SUGP2-214ENST00000600377 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SPIBQ01892 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SPIBQ01892 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SPIBQ01892 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SPIBQ01892 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SPIBQ01892 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SPIBQ01892 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SPIBQ01892 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SPIBQ01892 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
SPIBQ01892 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
SPIBQ01892 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
SPIBQ01892 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
SPIBQ01892 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SPIBQ01892 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SPIBQ01892 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SPIBQ01892 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
SPIBQ01892 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SPIBQ01892 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
SPIBQ01892 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SPIBQ01892 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SPIBQ01892 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
SPIBQ01892 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
SPIBQ01892 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SPIBQ01892 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SPIBQ01892 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC14.18□□□□□ -0.14
SPIBQ01892 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
SPIBQ01892 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
SPIBQ01892 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
SPIBQ01892 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms