Protein–RNA interactions for Protein: Q00444

HOXC5, Homeobox protein Hox-C5, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC5Q00444 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
HOXC5Q00444 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
HOXC5Q00444 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
HOXC5Q00444 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
HOXC5Q00444 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
HOXC5Q00444 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
HOXC5Q00444 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
HOXC5Q00444 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
HOXC5Q00444 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
HOXC5Q00444 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
HOXC5Q00444 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
HOXC5Q00444 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
HOXC5Q00444 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
HOXC5Q00444 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
HOXC5Q00444 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
HOXC5Q00444 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
HOXC5Q00444 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
HOXC5Q00444 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
HOXC5Q00444 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
HOXC5Q00444 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
HOXC5Q00444 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
HOXC5Q00444 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
HOXC5Q00444 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
HOXC5Q00444 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
HOXC5Q00444 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
HOXC5Q00444 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
HOXC5Q00444 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
HOXC5Q00444 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
HOXC5Q00444 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
HOXC5Q00444 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
HOXC5Q00444 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
HOXC5Q00444 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
HOXC5Q00444 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
HOXC5Q00444 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
HOXC5Q00444 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
HOXC5Q00444 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
HOXC5Q00444 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
HOXC5Q00444 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
HOXC5Q00444 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
HOXC5Q00444 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
HOXC5Q00444 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
HOXC5Q00444 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
HOXC5Q00444 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
HOXC5Q00444 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
HOXC5Q00444 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
HOXC5Q00444 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
HOXC5Q00444 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
HOXC5Q00444 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
HOXC5Q00444 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
HOXC5Q00444 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
HOXC5Q00444 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
HOXC5Q00444 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
HOXC5Q00444 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
HOXC5Q00444 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
HOXC5Q00444 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
HOXC5Q00444 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
HOXC5Q00444 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
HOXC5Q00444 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
HOXC5Q00444 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
HOXC5Q00444 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
HOXC5Q00444 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
HOXC5Q00444 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
HOXC5Q00444 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
HOXC5Q00444 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
HOXC5Q00444 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
HOXC5Q00444 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
HOXC5Q00444 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
HOXC5Q00444 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
HOXC5Q00444 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
HOXC5Q00444 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
HOXC5Q00444 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
HOXC5Q00444 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
HOXC5Q00444 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
HOXC5Q00444 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
HOXC5Q00444 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
HOXC5Q00444 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
HOXC5Q00444 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
HOXC5Q00444 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
HOXC5Q00444 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
HOXC5Q00444 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
HOXC5Q00444 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
HOXC5Q00444 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC14.15□□□□□ -0.14
HOXC5Q00444 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
HOXC5Q00444 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
HOXC5Q00444 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
HOXC5Q00444 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
HOXC5Q00444 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
HOXC5Q00444 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
HOXC5Q00444 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
HOXC5Q00444 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
HOXC5Q00444 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.15□□□□□ -0.14
HOXC5Q00444 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
HOXC5Q00444 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
HOXC5Q00444 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
HOXC5Q00444 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
HOXC5Q00444 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
HOXC5Q00444 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
HOXC5Q00444 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
HOXC5Q00444 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
HOXC5Q00444 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms