Protein–RNA interactions for Protein: Q00059

TFAM, Transcription factor A, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFAMQ00059 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TFAMQ00059 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TFAMQ00059 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TFAMQ00059 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TFAMQ00059 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TFAMQ00059 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TFAMQ00059 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TFAMQ00059 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TFAMQ00059 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TFAMQ00059 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TFAMQ00059 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TFAMQ00059 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TFAMQ00059 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TFAMQ00059 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TFAMQ00059 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TFAMQ00059 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TFAMQ00059 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TFAMQ00059 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TFAMQ00059 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TFAMQ00059 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TFAMQ00059 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TFAMQ00059 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TFAMQ00059 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TFAMQ00059 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TFAMQ00059 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TFAMQ00059 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TFAMQ00059 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TFAMQ00059 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TFAMQ00059 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TFAMQ00059 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TFAMQ00059 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TFAMQ00059 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TFAMQ00059 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TFAMQ00059 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TFAMQ00059 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TFAMQ00059 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TFAMQ00059 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
TFAMQ00059 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TFAMQ00059 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TFAMQ00059 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TFAMQ00059 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
TFAMQ00059 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TFAMQ00059 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TFAMQ00059 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TFAMQ00059 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TFAMQ00059 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TFAMQ00059 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TFAMQ00059 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TFAMQ00059 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TFAMQ00059 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TFAMQ00059 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TFAMQ00059 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TFAMQ00059 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TFAMQ00059 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TFAMQ00059 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TFAMQ00059 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TFAMQ00059 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TFAMQ00059 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TFAMQ00059 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
TFAMQ00059 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
TFAMQ00059 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
TFAMQ00059 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
TFAMQ00059 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
TFAMQ00059 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
TFAMQ00059 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TFAMQ00059 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TFAMQ00059 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TFAMQ00059 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TFAMQ00059 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TFAMQ00059 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TFAMQ00059 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TFAMQ00059 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TFAMQ00059 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TFAMQ00059 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TFAMQ00059 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TFAMQ00059 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TFAMQ00059 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TFAMQ00059 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TFAMQ00059 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TFAMQ00059 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TFAMQ00059 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TFAMQ00059 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TFAMQ00059 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TFAMQ00059 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TFAMQ00059 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TFAMQ00059 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TFAMQ00059 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TFAMQ00059 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TFAMQ00059 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TFAMQ00059 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TFAMQ00059 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TFAMQ00059 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TFAMQ00059 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TFAMQ00059 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TFAMQ00059 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TFAMQ00059 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TFAMQ00059 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TFAMQ00059 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TFAMQ00059 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TFAMQ00059 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms