Protein–RNA interactions for Protein: P61221

ABCE1, ATP-binding cassette sub-family E member 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCE1P61221 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ABCE1P61221 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ABCE1P61221 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ABCE1P61221 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ABCE1P61221 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ABCE1P61221 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ABCE1P61221 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
ABCE1P61221 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ABCE1P61221 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ABCE1P61221 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ABCE1P61221 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
ABCE1P61221 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ABCE1P61221 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ABCE1P61221 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ABCE1P61221 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ABCE1P61221 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ABCE1P61221 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ABCE1P61221 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
ABCE1P61221 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ABCE1P61221 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ABCE1P61221 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ABCE1P61221 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
ABCE1P61221 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ABCE1P61221 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ABCE1P61221 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ABCE1P61221 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ABCE1P61221 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
ABCE1P61221 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ABCE1P61221 IL17RA-201ENST00000319363 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ABCE1P61221 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
ABCE1P61221 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ABCE1P61221 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ABCE1P61221 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ABCE1P61221 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ABCE1P61221 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ABCE1P61221 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ABCE1P61221 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ABCE1P61221 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ABCE1P61221 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ABCE1P61221 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ABCE1P61221 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ABCE1P61221 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ABCE1P61221 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ABCE1P61221 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ABCE1P61221 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ABCE1P61221 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ABCE1P61221 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ABCE1P61221 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ABCE1P61221 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ABCE1P61221 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ABCE1P61221 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ABCE1P61221 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ABCE1P61221 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ABCE1P61221 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ABCE1P61221 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ABCE1P61221 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ABCE1P61221 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ABCE1P61221 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ABCE1P61221 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ABCE1P61221 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ABCE1P61221 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
ABCE1P61221 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ABCE1P61221 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ABCE1P61221 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ABCE1P61221 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ABCE1P61221 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ABCE1P61221 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ABCE1P61221 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
ABCE1P61221 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ABCE1P61221 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ABCE1P61221 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
ABCE1P61221 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ABCE1P61221 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ABCE1P61221 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ABCE1P61221 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ABCE1P61221 CNKSR2-203ENST00000425654 5668 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ABCE1P61221 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ABCE1P61221 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ABCE1P61221 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ABCE1P61221 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ABCE1P61221 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ABCE1P61221 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ABCE1P61221 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ABCE1P61221 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
ABCE1P61221 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ABCE1P61221 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ABCE1P61221 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ABCE1P61221 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
ABCE1P61221 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ABCE1P61221 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
ABCE1P61221 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ABCE1P61221 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ABCE1P61221 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ABCE1P61221 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ABCE1P61221 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ABCE1P61221 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ABCE1P61221 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ABCE1P61221 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ABCE1P61221 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ABCE1P61221 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 182.3 ms