Protein–RNA interactions for Protein: P61088

UBE2N, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 N, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2NP61088 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
UBE2NP61088 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
UBE2NP61088 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
UBE2NP61088 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
UBE2NP61088 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
UBE2NP61088 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
UBE2NP61088 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
UBE2NP61088 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
UBE2NP61088 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
UBE2NP61088 DISC1-222ENST00000622252 6927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
UBE2NP61088 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
UBE2NP61088 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
UBE2NP61088 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
UBE2NP61088 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
UBE2NP61088 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
UBE2NP61088 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
UBE2NP61088 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
UBE2NP61088 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
UBE2NP61088 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
UBE2NP61088 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
UBE2NP61088 CCDC88A-201ENST00000263630 9667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
UBE2NP61088 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
UBE2NP61088 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
UBE2NP61088 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
UBE2NP61088 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
UBE2NP61088 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
UBE2NP61088 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
UBE2NP61088 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
UBE2NP61088 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
UBE2NP61088 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
UBE2NP61088 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
UBE2NP61088 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
UBE2NP61088 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
UBE2NP61088 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
UBE2NP61088 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
UBE2NP61088 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
UBE2NP61088 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
UBE2NP61088 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
UBE2NP61088 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
UBE2NP61088 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
UBE2NP61088 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
UBE2NP61088 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
UBE2NP61088 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
UBE2NP61088 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
UBE2NP61088 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
UBE2NP61088 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
UBE2NP61088 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
UBE2NP61088 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
UBE2NP61088 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
UBE2NP61088 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
UBE2NP61088 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
UBE2NP61088 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
UBE2NP61088 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
UBE2NP61088 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
UBE2NP61088 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
UBE2NP61088 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
UBE2NP61088 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
UBE2NP61088 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
UBE2NP61088 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
UBE2NP61088 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
UBE2NP61088 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
UBE2NP61088 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
UBE2NP61088 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
UBE2NP61088 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
UBE2NP61088 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
UBE2NP61088 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
UBE2NP61088 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
UBE2NP61088 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
UBE2NP61088 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
UBE2NP61088 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
UBE2NP61088 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
UBE2NP61088 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
UBE2NP61088 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
UBE2NP61088 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
UBE2NP61088 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
UBE2NP61088 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
UBE2NP61088 SETD1A-201ENST00000262519 6451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
UBE2NP61088 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
UBE2NP61088 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
UBE2NP61088 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
UBE2NP61088 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
UBE2NP61088 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
UBE2NP61088 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
UBE2NP61088 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
UBE2NP61088 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
UBE2NP61088 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
UBE2NP61088 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
UBE2NP61088 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
UBE2NP61088 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
UBE2NP61088 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
UBE2NP61088 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
UBE2NP61088 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
UBE2NP61088 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
UBE2NP61088 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
UBE2NP61088 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
UBE2NP61088 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
UBE2NP61088 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
UBE2NP61088 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
UBE2NP61088 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
UBE2NP61088 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC13.42□□□□□ -0.26
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