Protein–RNA interactions for Protein: P61011

SRP54, Signal recognition particle 54 kDa protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRP54P61011 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SRP54P61011 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SRP54P61011 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SRP54P61011 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SRP54P61011 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SRP54P61011 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SRP54P61011 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SRP54P61011 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SRP54P61011 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SRP54P61011 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SRP54P61011 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SRP54P61011 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SRP54P61011 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SRP54P61011 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SRP54P61011 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SRP54P61011 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SRP54P61011 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SRP54P61011 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SRP54P61011 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SRP54P61011 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SRP54P61011 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SRP54P61011 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SRP54P61011 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SRP54P61011 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SRP54P61011 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SRP54P61011 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SRP54P61011 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SRP54P61011 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SRP54P61011 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
SRP54P61011 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SRP54P61011 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SRP54P61011 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SRP54P61011 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SRP54P61011 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SRP54P61011 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SRP54P61011 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SRP54P61011 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SRP54P61011 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
SRP54P61011 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SRP54P61011 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SRP54P61011 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SRP54P61011 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SRP54P61011 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SRP54P61011 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SRP54P61011 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SRP54P61011 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SRP54P61011 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SRP54P61011 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SRP54P61011 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SRP54P61011 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SRP54P61011 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SRP54P61011 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SRP54P61011 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SRP54P61011 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SRP54P61011 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SRP54P61011 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SRP54P61011 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
SRP54P61011 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SRP54P61011 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SRP54P61011 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SRP54P61011 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SRP54P61011 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SRP54P61011 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SRP54P61011 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SRP54P61011 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SRP54P61011 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SRP54P61011 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SRP54P61011 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SRP54P61011 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SRP54P61011 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SRP54P61011 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SRP54P61011 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SRP54P61011 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SRP54P61011 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SRP54P61011 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SRP54P61011 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SRP54P61011 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SRP54P61011 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
SRP54P61011 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SRP54P61011 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SRP54P61011 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SRP54P61011 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SRP54P61011 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SRP54P61011 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SRP54P61011 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SRP54P61011 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SRP54P61011 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SRP54P61011 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SRP54P61011 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SRP54P61011 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SRP54P61011 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SRP54P61011 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SRP54P61011 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SRP54P61011 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SRP54P61011 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SRP54P61011 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SRP54P61011 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SRP54P61011 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SRP54P61011 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SRP54P61011 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.4 ms