Protein–RNA interactions for Protein: P59942

MCCD1, Mitochondrial coiled-coil domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCCD1P59942 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MCCD1P59942 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MCCD1P59942 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MCCD1P59942 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MCCD1P59942 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MCCD1P59942 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MCCD1P59942 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
MCCD1P59942 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MCCD1P59942 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MCCD1P59942 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MCCD1P59942 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MCCD1P59942 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MCCD1P59942 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MCCD1P59942 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MCCD1P59942 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MCCD1P59942 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
MCCD1P59942 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MCCD1P59942 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
MCCD1P59942 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MCCD1P59942 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MCCD1P59942 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MCCD1P59942 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MCCD1P59942 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MCCD1P59942 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MCCD1P59942 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MCCD1P59942 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MCCD1P59942 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MCCD1P59942 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MCCD1P59942 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MCCD1P59942 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MCCD1P59942 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MCCD1P59942 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MCCD1P59942 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MCCD1P59942 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MCCD1P59942 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
MCCD1P59942 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
MCCD1P59942 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
MCCD1P59942 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
MCCD1P59942 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MCCD1P59942 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MCCD1P59942 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MCCD1P59942 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MCCD1P59942 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MCCD1P59942 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MCCD1P59942 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MCCD1P59942 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MCCD1P59942 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MCCD1P59942 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MCCD1P59942 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MCCD1P59942 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MCCD1P59942 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MCCD1P59942 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MCCD1P59942 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
MCCD1P59942 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MCCD1P59942 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MCCD1P59942 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MCCD1P59942 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MCCD1P59942 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MCCD1P59942 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MCCD1P59942 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MCCD1P59942 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MCCD1P59942 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
MCCD1P59942 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MCCD1P59942 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MCCD1P59942 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MCCD1P59942 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MCCD1P59942 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
MCCD1P59942 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
MCCD1P59942 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MCCD1P59942 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MCCD1P59942 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MCCD1P59942 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MCCD1P59942 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
MCCD1P59942 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MCCD1P59942 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MCCD1P59942 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MCCD1P59942 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MCCD1P59942 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MCCD1P59942 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
MCCD1P59942 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MCCD1P59942 TMPRSS2-201ENST00000332149 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MCCD1P59942 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MCCD1P59942 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MCCD1P59942 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MCCD1P59942 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MCCD1P59942 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MCCD1P59942 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MCCD1P59942 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MCCD1P59942 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MCCD1P59942 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MCCD1P59942 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MCCD1P59942 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MCCD1P59942 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MCCD1P59942 CDC42SE2-202ENST00000395246 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MCCD1P59942 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MCCD1P59942 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MCCD1P59942 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MCCD1P59942 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MCCD1P59942 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
MCCD1P59942 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 119.7 ms