Protein–RNA interactions for Protein: P56748

CLDN8, Claudin-8, humanhuman

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Length 225 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN8P56748 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLDN8P56748 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLDN8P56748 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLDN8P56748 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLDN8P56748 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLDN8P56748 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLDN8P56748 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLDN8P56748 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLDN8P56748 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLDN8P56748 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLDN8P56748 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLDN8P56748 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLDN8P56748 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CLDN8P56748 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLDN8P56748 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLDN8P56748 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CLDN8P56748 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLDN8P56748 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CLDN8P56748 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLDN8P56748 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CLDN8P56748 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLDN8P56748 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLDN8P56748 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLDN8P56748 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLDN8P56748 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLDN8P56748 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLDN8P56748 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLDN8P56748 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLDN8P56748 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLDN8P56748 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLDN8P56748 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLDN8P56748 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLDN8P56748 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLDN8P56748 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLDN8P56748 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLDN8P56748 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLDN8P56748 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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CLDN8P56748 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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CLDN8P56748 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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CLDN8P56748 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLDN8P56748 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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CLDN8P56748 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLDN8P56748 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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CLDN8P56748 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLDN8P56748 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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CLDN8P56748 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLDN8P56748 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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CLDN8P56748 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLDN8P56748 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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CLDN8P56748 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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CLDN8P56748 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CLDN8P56748 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CLDN8P56748 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CLDN8P56748 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CLDN8P56748 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CLDN8P56748 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CLDN8P56748 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CLDN8P56748 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
CLDN8P56748 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
CLDN8P56748 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CLDN8P56748 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CLDN8P56748 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CLDN8P56748 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CLDN8P56748 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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