Protein–RNA interactions for Protein: P54198

HIRA, Protein HIRA, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,017 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRAP54198 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HIRAP54198 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HIRAP54198 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HIRAP54198 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HIRAP54198 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HIRAP54198 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HIRAP54198 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HIRAP54198 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HIRAP54198 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HIRAP54198 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HIRAP54198 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HIRAP54198 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HIRAP54198 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HIRAP54198 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HIRAP54198 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HIRAP54198 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HIRAP54198 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HIRAP54198 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HIRAP54198 Z69890.1-201ENST00000382990 339 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
HIRAP54198 RPS9-204ENST00000391753 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HIRAP54198 NPPC-202ENST00000409852 1051 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HIRAP54198 LYPLA2P1-203ENST00000447689 696 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
HIRAP54198 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HIRAP54198 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
HIRAP54198 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HIRAP54198 AC068397.2-201ENST00000558742 341 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HIRAP54198 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HIRAP54198 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HIRAP54198 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HIRAP54198 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HIRAP54198 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HIRAP54198 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HIRAP54198 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HIRAP54198 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HIRAP54198 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HIRAP54198 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HIRAP54198 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HIRAP54198 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HIRAP54198 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HIRAP54198 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HIRAP54198 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HIRAP54198 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HIRAP54198 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HIRAP54198 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HIRAP54198 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HIRAP54198 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HIRAP54198 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HIRAP54198 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HIRAP54198 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HIRAP54198 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HIRAP54198 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HIRAP54198 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HIRAP54198 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HIRAP54198 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HIRAP54198 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HIRAP54198 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HIRAP54198 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HIRAP54198 RAB25-201ENST00000361084 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HIRAP54198 PPDPF-202ENST00000370179 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HIRAP54198 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HIRAP54198 SERF2-206ENST00000409291 807 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HIRAP54198 MIR4435-2HG-204ENST00000419736 777 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HIRAP54198 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
HIRAP54198 TNNT2-214ENST00000458432 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HIRAP54198 AC026410.1-201ENST00000507366 1101 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
HIRAP54198 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HIRAP54198 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HIRAP54198 AC105137.3-201ENST00000617588 984 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
HIRAP54198 AC005618.3-201ENST00000624928 458 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
HIRAP54198 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HIRAP54198 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HIRAP54198 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HIRAP54198 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HIRAP54198 FHL2-206ENST00000408995 1367 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HIRAP54198 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HIRAP54198 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HIRAP54198 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HIRAP54198 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HIRAP54198 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HIRAP54198 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HIRAP54198 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HIRAP54198 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HIRAP54198 CNN1-201ENST00000252456 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HIRAP54198 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HIRAP54198 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HIRAP54198 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HIRAP54198 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HIRAP54198 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HIRAP54198 TMEM208-201ENST00000304800 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HIRAP54198 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HIRAP54198 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
HIRAP54198 LINC01433-201ENST00000419003 697 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HIRAP54198 CHCHD2P9-201ENST00000461726 456 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
HIRAP54198 MYLK-AS1-202ENST00000470449 760 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HIRAP54198 NCK1-AS1-203ENST00000474250 827 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HIRAP54198 AC107463.1-201ENST00000508605 667 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HIRAP54198 MEF2C-AS2-201ENST00000510274 463 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HIRAP54198 RPS25-202ENST00000527673 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HIRAP54198 SDHAF2-206ENST00000542074 835 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HIRAP54198 AC107464.3-201ENST00000609172 737 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms