Protein–RNA interactions for Protein: P50747

HLCS, Biotin--protein ligase, humanhuman

Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLCSP50747 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HLCSP50747 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HLCSP50747 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HLCSP50747 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HLCSP50747 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HLCSP50747 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
HLCSP50747 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HLCSP50747 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HLCSP50747 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HLCSP50747 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HLCSP50747 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HLCSP50747 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HLCSP50747 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HLCSP50747 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HLCSP50747 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HLCSP50747 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HLCSP50747 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
HLCSP50747 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
HLCSP50747 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HLCSP50747 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HLCSP50747 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HLCSP50747 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HLCSP50747 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HLCSP50747 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HLCSP50747 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
HLCSP50747 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HLCSP50747 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HLCSP50747 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HLCSP50747 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HLCSP50747 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HLCSP50747 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HLCSP50747 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HLCSP50747 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HLCSP50747 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HLCSP50747 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HLCSP50747 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HLCSP50747 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HLCSP50747 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HLCSP50747 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HLCSP50747 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HLCSP50747 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HLCSP50747 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HLCSP50747 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HLCSP50747 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HLCSP50747 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HLCSP50747 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HLCSP50747 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HLCSP50747 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HLCSP50747 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HLCSP50747 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HLCSP50747 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HLCSP50747 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HLCSP50747 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HLCSP50747 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HLCSP50747 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
HLCSP50747 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
HLCSP50747 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HLCSP50747 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HLCSP50747 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HLCSP50747 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HLCSP50747 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
HLCSP50747 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HLCSP50747 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HLCSP50747 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HLCSP50747 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HLCSP50747 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HLCSP50747 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HLCSP50747 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HLCSP50747 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
HLCSP50747 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HLCSP50747 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HLCSP50747 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HLCSP50747 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HLCSP50747 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HLCSP50747 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HLCSP50747 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HLCSP50747 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HLCSP50747 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HLCSP50747 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HLCSP50747 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HLCSP50747 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HLCSP50747 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HLCSP50747 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HLCSP50747 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HLCSP50747 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HLCSP50747 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HLCSP50747 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HLCSP50747 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HLCSP50747 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HLCSP50747 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HLCSP50747 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HLCSP50747 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HLCSP50747 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HLCSP50747 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HLCSP50747 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HLCSP50747 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HLCSP50747 AC016876.1-201ENST00000415124 352 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HLCSP50747 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HLCSP50747 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
HLCSP50747 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms