Protein–RNA interactions for Protein: P50440

GATM, Glycine amidinotransferase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATMP50440 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GATMP50440 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GATMP50440 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GATMP50440 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GATMP50440 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GATMP50440 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GATMP50440 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GATMP50440 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GATMP50440 AWAT1-201ENST00000374521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GATMP50440 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GATMP50440 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GATMP50440 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GATMP50440 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GATMP50440 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GATMP50440 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GATMP50440 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GATMP50440 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GATMP50440 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GATMP50440 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GATMP50440 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GATMP50440 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GATMP50440 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GATMP50440 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GATMP50440 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GATMP50440 CABP1-203ENST00000351200 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GATMP50440 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GATMP50440 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GATMP50440 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GATMP50440 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GATMP50440 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GATMP50440 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GATMP50440 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GATMP50440 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GATMP50440 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GATMP50440 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GATMP50440 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GATMP50440 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GATMP50440 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GATMP50440 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GATMP50440 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GATMP50440 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GATMP50440 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GATMP50440 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GATMP50440 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GATMP50440 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GATMP50440 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GATMP50440 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GATMP50440 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GATMP50440 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GATMP50440 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GATMP50440 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GATMP50440 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GATMP50440 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GATMP50440 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GATMP50440 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GATMP50440 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GATMP50440 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GATMP50440 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GATMP50440 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GATMP50440 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GATMP50440 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GATMP50440 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GATMP50440 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GATMP50440 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GATMP50440 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GATMP50440 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GATMP50440 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GATMP50440 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GATMP50440 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GATMP50440 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GATMP50440 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GATMP50440 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GATMP50440 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GATMP50440 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GATMP50440 AL139246.4-201ENST00000442305 514 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GATMP50440 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GATMP50440 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GATMP50440 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GATMP50440 BHMT-206ENST00000524080 1207 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GATMP50440 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GATMP50440 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GATMP50440 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GATMP50440 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GATMP50440 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GATMP50440 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GATMP50440 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GATMP50440 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GATMP50440 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GATMP50440 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GATMP50440 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GATMP50440 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GATMP50440 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GATMP50440 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GATMP50440 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GATMP50440 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GATMP50440 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GATMP50440 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GATMP50440 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GATMP50440 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GATMP50440 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms