Protein–RNA interactions for Protein: P48058

GRIA4, Glutamate receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA4P48058 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GRIA4P48058 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GRIA4P48058 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GRIA4P48058 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GRIA4P48058 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GRIA4P48058 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GRIA4P48058 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GRIA4P48058 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GRIA4P48058 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GRIA4P48058 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GRIA4P48058 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GRIA4P48058 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GRIA4P48058 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GRIA4P48058 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GRIA4P48058 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GRIA4P48058 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GRIA4P48058 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GRIA4P48058 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GRIA4P48058 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GRIA4P48058 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GRIA4P48058 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GRIA4P48058 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GRIA4P48058 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GRIA4P48058 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GRIA4P48058 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GRIA4P48058 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GRIA4P48058 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GRIA4P48058 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GRIA4P48058 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GRIA4P48058 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GRIA4P48058 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GRIA4P48058 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GRIA4P48058 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GRIA4P48058 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GRIA4P48058 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GRIA4P48058 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GRIA4P48058 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GRIA4P48058 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GRIA4P48058 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GRIA4P48058 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GRIA4P48058 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GRIA4P48058 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GRIA4P48058 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GRIA4P48058 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GRIA4P48058 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GRIA4P48058 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
GRIA4P48058 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GRIA4P48058 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GRIA4P48058 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
GRIA4P48058 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
GRIA4P48058 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GRIA4P48058 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GRIA4P48058 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GRIA4P48058 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GRIA4P48058 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GRIA4P48058 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GRIA4P48058 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GRIA4P48058 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GRIA4P48058 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GRIA4P48058 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GRIA4P48058 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GRIA4P48058 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GRIA4P48058 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GRIA4P48058 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GRIA4P48058 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GRIA4P48058 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GRIA4P48058 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GRIA4P48058 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GRIA4P48058 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GRIA4P48058 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GRIA4P48058 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GRIA4P48058 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GRIA4P48058 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
GRIA4P48058 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GRIA4P48058 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
GRIA4P48058 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GRIA4P48058 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GRIA4P48058 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GRIA4P48058 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GRIA4P48058 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GRIA4P48058 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GRIA4P48058 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GRIA4P48058 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GRIA4P48058 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GRIA4P48058 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
GRIA4P48058 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GRIA4P48058 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GRIA4P48058 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GRIA4P48058 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
GRIA4P48058 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GRIA4P48058 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GRIA4P48058 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GRIA4P48058 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GRIA4P48058 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GRIA4P48058 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
GRIA4P48058 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GRIA4P48058 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GRIA4P48058 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
GRIA4P48058 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GRIA4P48058 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.4 ms