Protein–RNA interactions for Protein: P46527

CDKN1B, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1B, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN1BP46527 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 AC036214.1-201ENST00000502766 2126 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 FAM156A-208ENST00000615092 2098 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 ESPN-201ENST00000377828 3531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 DLX1-203ENST00000361725 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 FAM86C1-201ENST00000346333 2010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 FUT1-201ENST00000310160 4246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 PNPLA5-205ENST00000597664 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 KLHL34-201ENST00000379499 3641 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 BAK1-203ENST00000442998 2212 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 CFAP74-209ENST00000493964 5247 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 SF1-202ENST00000334944 3094 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.68□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 TMPO-202ENST00000266732 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 SPIN3-204ENST00000638257 4835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 SLC35F2-203ENST00000525071 3331 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.1 ms