Protein–RNA interactions for Protein: P46060

RANGAP1, Ran GTPase-activating protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RANGAP1P46060 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RANGAP1P46060 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RANGAP1P46060 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RANGAP1P46060 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RANGAP1P46060 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RANGAP1P46060 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RANGAP1P46060 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RANGAP1P46060 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RANGAP1P46060 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
RANGAP1P46060 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RANGAP1P46060 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RANGAP1P46060 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RANGAP1P46060 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RANGAP1P46060 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RANGAP1P46060 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RANGAP1P46060 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RANGAP1P46060 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RANGAP1P46060 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RANGAP1P46060 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RANGAP1P46060 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RANGAP1P46060 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RANGAP1P46060 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RANGAP1P46060 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RANGAP1P46060 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RANGAP1P46060 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
RANGAP1P46060 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RANGAP1P46060 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RANGAP1P46060 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RANGAP1P46060 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RANGAP1P46060 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RANGAP1P46060 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
RANGAP1P46060 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RANGAP1P46060 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RANGAP1P46060 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
RANGAP1P46060 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
RANGAP1P46060 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RANGAP1P46060 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RANGAP1P46060 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RANGAP1P46060 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RANGAP1P46060 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RANGAP1P46060 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RANGAP1P46060 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RANGAP1P46060 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RANGAP1P46060 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RANGAP1P46060 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RANGAP1P46060 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RANGAP1P46060 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RANGAP1P46060 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
RANGAP1P46060 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RANGAP1P46060 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
RANGAP1P46060 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RANGAP1P46060 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RANGAP1P46060 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RANGAP1P46060 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RANGAP1P46060 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RANGAP1P46060 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RANGAP1P46060 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RANGAP1P46060 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RANGAP1P46060 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RANGAP1P46060 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RANGAP1P46060 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RANGAP1P46060 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RANGAP1P46060 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RANGAP1P46060 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RANGAP1P46060 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RANGAP1P46060 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RANGAP1P46060 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RANGAP1P46060 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
RANGAP1P46060 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
RANGAP1P46060 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RANGAP1P46060 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RANGAP1P46060 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RANGAP1P46060 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RANGAP1P46060 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RANGAP1P46060 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RANGAP1P46060 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
RANGAP1P46060 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RANGAP1P46060 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RANGAP1P46060 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RANGAP1P46060 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RANGAP1P46060 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RANGAP1P46060 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
RANGAP1P46060 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RANGAP1P46060 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RANGAP1P46060 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
RANGAP1P46060 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
RANGAP1P46060 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
RANGAP1P46060 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RANGAP1P46060 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RANGAP1P46060 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RANGAP1P46060 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RANGAP1P46060 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RANGAP1P46060 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RANGAP1P46060 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RANGAP1P46060 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RANGAP1P46060 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RANGAP1P46060 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RANGAP1P46060 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RANGAP1P46060 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RANGAP1P46060 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms