Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
TMPOP42166 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
TMPOP42166 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
TMPOP42166 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
TMPOP42166 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
TMPOP42166 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
TMPOP42166 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
TMPOP42166 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
TMPOP42166 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
TMPOP42166 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
TMPOP42166 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TMPOP42166 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TMPOP42166 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TMPOP42166 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TMPOP42166 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TMPOP42166 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
TMPOP42166 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TMPOP42166 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TMPOP42166 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TMPOP42166 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
TMPOP42166 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TMPOP42166 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TMPOP42166 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TMPOP42166 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TMPOP42166 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TMPOP42166 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TMPOP42166 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TMPOP42166 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TMPOP42166 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TMPOP42166 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TMPOP42166 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TMPOP42166 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TMPOP42166 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TMPOP42166 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TMPOP42166 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
TMPOP42166 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TMPOP42166 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TMPOP42166 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TMPOP42166 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TMPOP42166 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TMPOP42166 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TMPOP42166 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
TMPOP42166 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TMPOP42166 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TMPOP42166 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TMPOP42166 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TMPOP42166 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TMPOP42166 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TMPOP42166 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TMPOP42166 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TMPOP42166 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TMPOP42166 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TMPOP42166 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TMPOP42166 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TMPOP42166 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TMPOP42166 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TMPOP42166 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TMPOP42166 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TMPOP42166 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TMPOP42166 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TMPOP42166 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TMPOP42166 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TMPOP42166 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TMPOP42166 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
TMPOP42166 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TMPOP42166 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TMPOP42166 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
TMPOP42166 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TMPOP42166 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TMPOP42166 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
TMPOP42166 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TMPOP42166 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
TMPOP42166 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TMPOP42166 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TMPOP42166 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
TMPOP42166 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TMPOP42166 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
TMPOP42166 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TMPOP42166 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TMPOP42166 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TMPOP42166 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TMPOP42166 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TMPOP42166 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TMPOP42166 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TMPOP42166 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TMPOP42166 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TMPOP42166 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TMPOP42166 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TMPOP42166 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TMPOP42166 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TMPOP42166 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TMPOP42166 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TMPOP42166 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TMPOP42166 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TMPOP42166 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TMPOP42166 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TMPOP42166 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TMPOP42166 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TMPOP42166 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TMPOP42166 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
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