Protein–RNA interactions for Protein: P38435

GGCX, Vitamin K-dependent gamma-carboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGCXP38435 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GGCXP38435 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GGCXP38435 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GGCXP38435 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GGCXP38435 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GGCXP38435 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
GGCXP38435 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GGCXP38435 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GGCXP38435 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
GGCXP38435 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GGCXP38435 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GGCXP38435 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GGCXP38435 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GGCXP38435 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GGCXP38435 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GGCXP38435 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GGCXP38435 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GGCXP38435 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GGCXP38435 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GGCXP38435 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GGCXP38435 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GGCXP38435 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GGCXP38435 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GGCXP38435 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GGCXP38435 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GGCXP38435 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
GGCXP38435 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GGCXP38435 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GGCXP38435 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GGCXP38435 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GGCXP38435 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GGCXP38435 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GGCXP38435 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GGCXP38435 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GGCXP38435 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
GGCXP38435 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
GGCXP38435 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
GGCXP38435 BNIP3P41-202ENST00000616656 861 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
GGCXP38435 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
GGCXP38435 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GGCXP38435 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GGCXP38435 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GGCXP38435 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GGCXP38435 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GGCXP38435 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GGCXP38435 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GGCXP38435 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GGCXP38435 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GGCXP38435 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GGCXP38435 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GGCXP38435 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GGCXP38435 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GGCXP38435 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GGCXP38435 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GGCXP38435 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GGCXP38435 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GGCXP38435 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GGCXP38435 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GGCXP38435 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GGCXP38435 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GGCXP38435 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GGCXP38435 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GGCXP38435 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GGCXP38435 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GGCXP38435 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GGCXP38435 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GGCXP38435 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GGCXP38435 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GGCXP38435 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GGCXP38435 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GGCXP38435 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GGCXP38435 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GGCXP38435 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GGCXP38435 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
GGCXP38435 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GGCXP38435 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GGCXP38435 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
GGCXP38435 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GGCXP38435 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GGCXP38435 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
GGCXP38435 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
GGCXP38435 OR10AC1-201ENST00000439431 2898 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GGCXP38435 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GGCXP38435 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GGCXP38435 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GGCXP38435 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GGCXP38435 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GGCXP38435 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GGCXP38435 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GGCXP38435 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GGCXP38435 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GGCXP38435 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GGCXP38435 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
GGCXP38435 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GGCXP38435 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GGCXP38435 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GGCXP38435 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GGCXP38435 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GGCXP38435 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GGCXP38435 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms