Protein–RNA interactions for Protein: P37231

PPARG, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGP37231 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PPARGP37231 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PPARGP37231 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PPARGP37231 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PPARGP37231 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PPARGP37231 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PPARGP37231 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PPARGP37231 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PPARGP37231 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PPARGP37231 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PPARGP37231 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PPARGP37231 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PPARGP37231 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PPARGP37231 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PPARGP37231 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PPARGP37231 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PPARGP37231 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PPARGP37231 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PPARGP37231 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PPARGP37231 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PPARGP37231 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PPARGP37231 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PPARGP37231 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PPARGP37231 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PPARGP37231 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PPARGP37231 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PPARGP37231 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PPARGP37231 EIF4G3-204ENST00000374935 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PPARGP37231 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PPARGP37231 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PPARGP37231 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PPARGP37231 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PPARGP37231 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PPARGP37231 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PPARGP37231 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PPARGP37231 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PPARGP37231 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PPARGP37231 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PPARGP37231 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PPARGP37231 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PPARGP37231 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PPARGP37231 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PPARGP37231 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PPARGP37231 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PPARGP37231 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PPARGP37231 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PPARGP37231 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PPARGP37231 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PPARGP37231 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PPARGP37231 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PPARGP37231 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PPARGP37231 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PPARGP37231 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PPARGP37231 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PPARGP37231 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PPARGP37231 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PPARGP37231 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PPARGP37231 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PPARGP37231 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PPARGP37231 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PPARGP37231 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PPARGP37231 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PPARGP37231 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PPARGP37231 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PPARGP37231 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.06
PPARGP37231 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PPARGP37231 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PPARGP37231 SBF1-202ENST00000380817 8008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PPARGP37231 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PPARGP37231 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PPARGP37231 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PPARGP37231 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PPARGP37231 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PPARGP37231 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PPARGP37231 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PPARGP37231 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PPARGP37231 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PPARGP37231 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PPARGP37231 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PPARGP37231 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PPARGP37231 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PPARGP37231 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PPARGP37231 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PPARGP37231 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PPARGP37231 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PPARGP37231 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PPARGP37231 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PPARGP37231 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PPARGP37231 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PPARGP37231 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PPARGP37231 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PPARGP37231 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PPARGP37231 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PPARGP37231 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PPARGP37231 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PPARGP37231 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PPARGP37231 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PPARGP37231 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PPARGP37231 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PPARGP37231 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.7 ms