Protein–RNA interactions for Protein: P36941

LTBR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBRP36941 DUX4L50-201ENST00000455245 715 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LTBRP36941 DPY19L2P5-201ENST00000456300 331 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LTBRP36941 AC093627.2-201ENST00000497017 568 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LTBRP36941 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LTBRP36941 TMEM126A-203ENST00000528105 656 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LTBRP36941 CMTM5-208ENST00000555731 831 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LTBRP36941 PGPEP1-206ENST00000597431 545 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LTBRP36941 AC114296.1-204ENST00000637197 1173 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LTBRP36941 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LTBRP36941 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LTBRP36941 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LTBRP36941 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LTBRP36941 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LTBRP36941 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LTBRP36941 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LTBRP36941 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LTBRP36941 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LTBRP36941 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LTBRP36941 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LTBRP36941 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LTBRP36941 FBXO16-202ENST00000380254 1343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LTBRP36941 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LTBRP36941 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LTBRP36941 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LTBRP36941 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LTBRP36941 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LTBRP36941 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LTBRP36941 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LTBRP36941 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LTBRP36941 ELP5-203ENST00000396627 1389 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LTBRP36941 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LTBRP36941 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LTBRP36941 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LTBRP36941 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LTBRP36941 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LTBRP36941 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LTBRP36941 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LTBRP36941 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LTBRP36941 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LTBRP36941 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LTBRP36941 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LTBRP36941 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LTBRP36941 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LTBRP36941 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LTBRP36941 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LTBRP36941 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LTBRP36941 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LTBRP36941 PPM1N-201ENST00000396735 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LTBRP36941 PHACTR2-204ENST00000397980 745 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LTBRP36941 C1QA-202ENST00000402322 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LTBRP36941 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LTBRP36941 KRT17P4-201ENST00000429445 819 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LTBRP36941 AC013448.2-201ENST00000440341 787 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LTBRP36941 PPM1N-208ENST00000456399 618 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LTBRP36941 OR2T27-202ENST00000460972 1136 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LTBRP36941 SOX2-OT-208ENST00000477928 902 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LTBRP36941 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LTBRP36941 RNA5SP417-201ENST00000516459 108 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LTBRP36941 PTGR1-209ENST00000538962 1200 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LTBRP36941 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LTBRP36941 AC136944.4-201ENST00000568893 660 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LTBRP36941 LINC01569-203ENST00000573268 694 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LTBRP36941 AC136624.2-201ENST00000574883 542 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LTBRP36941 SPINT2-204ENST00000587090 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LTBRP36941 TMEM205-210ENST00000588560 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LTBRP36941 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LTBRP36941 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LTBRP36941 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LTBRP36941 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LTBRP36941 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LTBRP36941 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LTBRP36941 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LTBRP36941 TNFRSF1A-202ENST00000366159 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LTBRP36941 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LTBRP36941 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LTBRP36941 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LTBRP36941 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LTBRP36941 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LTBRP36941 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LTBRP36941 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LTBRP36941 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LTBRP36941 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LTBRP36941 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LTBRP36941 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LTBRP36941 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LTBRP36941 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LTBRP36941 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LTBRP36941 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LTBRP36941 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LTBRP36941 S100A3-202ENST00000368713 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LTBRP36941 AC097059.1-201ENST00000413103 885 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LTBRP36941 GUSBP10-201ENST00000417412 665 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LTBRP36941 AL390778.2-201ENST00000420883 886 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LTBRP36941 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LTBRP36941 C17orf58-202ENST00000449250 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LTBRP36941 SIX3-AS1-202ENST00000456467 557 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LTBRP36941 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LTBRP36941 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LTBRP36941 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LTBRP36941 AC020659.1-202ENST00000564432 531 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.4 ms