Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 AP000769.1-203ENST00000637245 208 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPRMP28827 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPRMP28827 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPRMP28827 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPRMP28827 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPRMP28827 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPRMP28827 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPRMP28827 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPRMP28827 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPRMP28827 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPRMP28827 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPRMP28827 MC5R-201ENST00000324750 1319 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPRMP28827 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPRMP28827 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPRMP28827 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPRMP28827 HIST1H2BF-201ENST00000356530 1196 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPRMP28827 TEX33-201ENST00000381821 978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPRMP28827 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPRMP28827 ACYP2-204ENST00000422521 1115 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPRMP28827 AC006372.2-201ENST00000433660 292 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPRMP28827 GPX3-202ENST00000517973 612 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPRMP28827 PAX5-210ENST00000520281 969 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPRMP28827 TMEM123-208ENST00000532161 743 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPRMP28827 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPRMP28827 AC104590.1-201ENST00000560813 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPRMP28827 AC009163.5-202ENST00000571737 466 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPRMP28827 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPRMP28827 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPRMP28827 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPRMP28827 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPRMP28827 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPRMP28827 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPRMP28827 FAM168A-202ENST00000356467 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPRMP28827 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPRMP28827 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPRMP28827 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPRMP28827 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPRMP28827 PCBD1-201ENST00000299299 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTPRMP28827 RNF212-201ENST00000333673 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTPRMP28827 DKKL1P1-201ENST00000400550 698 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
PTPRMP28827 DDX39B-AS1-208ENST00000420520 516 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTPRMP28827 FAM197Y6-201ENST00000420524 766 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
PTPRMP28827 GRAMD1A-203ENST00000424536 808 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTPRMP28827 EEF1DP5-201ENST00000431410 772 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
PTPRMP28827 RPL18AP8-201ENST00000486071 528 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
PTPRMP28827 AC097381.2-201ENST00000510640 859 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTPRMP28827 AC104961.2-201ENST00000578129 663 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTPRMP28827 ZNF677-204ENST00000594681 935 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTPRMP28827 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTPRMP28827 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTPRMP28827 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTPRMP28827 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTPRMP28827 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTPRMP28827 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTPRMP28827 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTPRMP28827 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTPRMP28827 PAIP2-201ENST00000265192 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTPRMP28827 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PTPRMP28827 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PTPRMP28827 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PTPRMP28827 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PTPRMP28827 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PTPRMP28827 UPK1A-201ENST00000222275 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PTPRMP28827 UPK1A-202ENST00000379013 1016 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PTPRMP28827 PYM1-203ENST00000408946 1226 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PTPRMP28827 KRT8P30-201ENST00000432100 650 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
PTPRMP28827 Z82249.1-201ENST00000453866 568 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PTPRMP28827 SCARNA12-201ENST00000459155 270 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
PTPRMP28827 AC006529.1-201ENST00000459978 637 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
PTPRMP28827 RNA5SP406-201ENST00000516106 112 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
PTPRMP28827 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PTPRMP28827 LAMTOR1-208ENST00000545249 965 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PTPRMP28827 AC013553.1-201ENST00000560906 267 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
PTPRMP28827 MT2A-202ENST00000561491 581 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PTPRMP28827 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
PTPRMP28827 KLKP1-202ENST00000597246 1125 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PTPRMP28827 RNF103-CHMP3-202ENST00000604011 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PTPRMP28827 CCDC113-206ENST00000616795 891 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PTPRMP28827 ST5-261ENST00000626808 1071 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PTPRMP28827 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
PTPRMP28827 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPRMP28827 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPRMP28827 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPRMP28827 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPRMP28827 COLQ-202ENST00000383786 1482 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPRMP28827 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPRMP28827 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPRMP28827 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPRMP28827 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPRMP28827 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPRMP28827 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPRMP28827 UPK1A-203ENST00000616789 1366 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPRMP28827 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPRMP28827 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPRMP28827 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPRMP28827 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPRMP28827 U2AF1L4-201ENST00000292879 729 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPRMP28827 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPRMP28827 SNORA57-201ENST00000383870 149 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPRMP28827 AC098657.1-201ENST00000416270 1135 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
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