Protein–RNA interactions for Protein: P28749

RBL1, Retinoblastoma-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBL1P28749 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RBL1P28749 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
RBL1P28749 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
RBL1P28749 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RBL1P28749 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RBL1P28749 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RBL1P28749 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RBL1P28749 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RBL1P28749 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RBL1P28749 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RBL1P28749 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RBL1P28749 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RBL1P28749 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RBL1P28749 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RBL1P28749 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RBL1P28749 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RBL1P28749 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RBL1P28749 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RBL1P28749 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RBL1P28749 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RBL1P28749 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RBL1P28749 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RBL1P28749 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RBL1P28749 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RBL1P28749 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RBL1P28749 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RBL1P28749 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RBL1P28749 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RBL1P28749 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RBL1P28749 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RBL1P28749 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RBL1P28749 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RBL1P28749 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RBL1P28749 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RBL1P28749 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RBL1P28749 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RBL1P28749 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RBL1P28749 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RBL1P28749 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RBL1P28749 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RBL1P28749 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RBL1P28749 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RBL1P28749 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RBL1P28749 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RBL1P28749 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RBL1P28749 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RBL1P28749 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RBL1P28749 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RBL1P28749 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RBL1P28749 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RBL1P28749 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RBL1P28749 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RBL1P28749 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RBL1P28749 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
RBL1P28749 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RBL1P28749 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RBL1P28749 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RBL1P28749 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RBL1P28749 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RBL1P28749 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RBL1P28749 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RBL1P28749 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RBL1P28749 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RBL1P28749 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RBL1P28749 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RBL1P28749 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RBL1P28749 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RBL1P28749 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RBL1P28749 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RBL1P28749 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RBL1P28749 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RBL1P28749 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
RBL1P28749 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RBL1P28749 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RBL1P28749 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RBL1P28749 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RBL1P28749 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RBL1P28749 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RBL1P28749 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RBL1P28749 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RBL1P28749 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RBL1P28749 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RBL1P28749 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RBL1P28749 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
RBL1P28749 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
RBL1P28749 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RBL1P28749 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RBL1P28749 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RBL1P28749 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RBL1P28749 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RBL1P28749 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RBL1P28749 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RBL1P28749 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RBL1P28749 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RBL1P28749 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RBL1P28749 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
RBL1P28749 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RBL1P28749 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
RBL1P28749 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
RBL1P28749 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms