Protein–RNA interactions for Protein: P26640

VARS, Valine--tRNA ligase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VARSP26640 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VARSP26640 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VARSP26640 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VARSP26640 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VARSP26640 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VARSP26640 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VARSP26640 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VARSP26640 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VARSP26640 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
VARSP26640 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VARSP26640 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VARSP26640 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VARSP26640 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VARSP26640 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VARSP26640 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VARSP26640 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VARSP26640 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VARSP26640 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VARSP26640 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VARSP26640 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
VARSP26640 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
VARSP26640 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
VARSP26640 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
VARSP26640 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
VARSP26640 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
VARSP26640 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VARSP26640 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC15.08■□□□□ 0
VARSP26640 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VARSP26640 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
VARSP26640 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VARSP26640 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
VARSP26640 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
VARSP26640 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VARSP26640 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
VARSP26640 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
VARSP26640 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VARSP26640 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
VARSP26640 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
VARSP26640 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
VARSP26640 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC15.08■□□□□ 0
VARSP26640 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
VARSP26640 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC15.08■□□□□ 0
VARSP26640 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
VARSP26640 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC15.08■□□□□ 0
VARSP26640 RN7SL121P-201ENST00000584223 273 ntBASIC15.08■□□□□ 0
VARSP26640 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
VARSP26640 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
VARSP26640 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
VARSP26640 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC15.08■□□□□ 0
VARSP26640 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VARSP26640 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
VARSP26640 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
VARSP26640 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
VARSP26640 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VARSP26640 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VARSP26640 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
VARSP26640 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
VARSP26640 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VARSP26640 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
VARSP26640 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VARSP26640 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VARSP26640 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VARSP26640 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
VARSP26640 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
VARSP26640 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VARSP26640 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC15.08■□□□□ 0
VARSP26640 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VARSP26640 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
VARSP26640 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VARSP26640 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VARSP26640 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
VARSP26640 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
VARSP26640 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
VARSP26640 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VARSP26640 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VARSP26640 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
VARSP26640 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VARSP26640 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.07■□□□□ 0
VARSP26640 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VARSP26640 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VARSP26640 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VARSP26640 DMTN-214ENST00000519907 2658 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
VARSP26640 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VARSP26640 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VARSP26640 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VARSP26640 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VARSP26640 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
VARSP26640 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VARSP26640 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
VARSP26640 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VARSP26640 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
VARSP26640 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VARSP26640 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
VARSP26640 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC15.07■□□□□ 0
VARSP26640 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
VARSP26640 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VARSP26640 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
VARSP26640 AC124312.2-201ENST00000546615 427 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
VARSP26640 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
VARSP26640 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.9 ms