Protein–RNA interactions for Protein: P22607

FGFR3, Fibroblast growth factor receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGFR3P22607 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FGFR3P22607 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FGFR3P22607 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FGFR3P22607 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FGFR3P22607 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FGFR3P22607 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
FGFR3P22607 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
FGFR3P22607 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FGFR3P22607 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
FGFR3P22607 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FGFR3P22607 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FGFR3P22607 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
FGFR3P22607 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FGFR3P22607 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
FGFR3P22607 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
FGFR3P22607 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FGFR3P22607 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FGFR3P22607 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FGFR3P22607 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FGFR3P22607 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FGFR3P22607 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FGFR3P22607 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FGFR3P22607 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FGFR3P22607 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FGFR3P22607 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FGFR3P22607 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FGFR3P22607 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FGFR3P22607 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FGFR3P22607 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FGFR3P22607 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FGFR3P22607 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FGFR3P22607 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FGFR3P22607 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FGFR3P22607 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FGFR3P22607 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FGFR3P22607 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FGFR3P22607 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FGFR3P22607 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FGFR3P22607 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FGFR3P22607 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FGFR3P22607 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
FGFR3P22607 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FGFR3P22607 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FGFR3P22607 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FGFR3P22607 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FGFR3P22607 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
FGFR3P22607 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FGFR3P22607 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FGFR3P22607 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FGFR3P22607 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FGFR3P22607 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FGFR3P22607 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
FGFR3P22607 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FGFR3P22607 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FGFR3P22607 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FGFR3P22607 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
FGFR3P22607 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FGFR3P22607 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FGFR3P22607 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FGFR3P22607 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FGFR3P22607 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
FGFR3P22607 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FGFR3P22607 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FGFR3P22607 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
FGFR3P22607 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FGFR3P22607 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FGFR3P22607 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FGFR3P22607 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FGFR3P22607 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FGFR3P22607 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FGFR3P22607 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FGFR3P22607 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FGFR3P22607 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FGFR3P22607 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FGFR3P22607 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FGFR3P22607 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FGFR3P22607 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FGFR3P22607 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FGFR3P22607 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
FGFR3P22607 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FGFR3P22607 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FGFR3P22607 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FGFR3P22607 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FGFR3P22607 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FGFR3P22607 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FGFR3P22607 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FGFR3P22607 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FGFR3P22607 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FGFR3P22607 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
FGFR3P22607 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FGFR3P22607 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FGFR3P22607 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FGFR3P22607 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FGFR3P22607 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FGFR3P22607 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FGFR3P22607 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FGFR3P22607 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FGFR3P22607 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FGFR3P22607 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FGFR3P22607 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms