Protein–RNA interactions for Protein: P20700

LMNB1, Lamin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNB1P20700 NPTN-204ENST00000562924 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LMNB1P20700 PIN1-207ENST00000588695 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LMNB1P20700 AC107464.3-201ENST00000609172 737 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
LMNB1P20700 ETV2-207ENST00000619399 994 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LMNB1P20700 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LMNB1P20700 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LMNB1P20700 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LMNB1P20700 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LMNB1P20700 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LMNB1P20700 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LMNB1P20700 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LMNB1P20700 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LMNB1P20700 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LMNB1P20700 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LMNB1P20700 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LMNB1P20700 TAGLN3-201ENST00000273368 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LMNB1P20700 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LMNB1P20700 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LMNB1P20700 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
LMNB1P20700 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LMNB1P20700 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LMNB1P20700 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LMNB1P20700 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LMNB1P20700 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LMNB1P20700 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LMNB1P20700 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LMNB1P20700 LINC02537-201ENST00000635943 1367 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LMNB1P20700 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LMNB1P20700 HBB-201ENST00000335295 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LMNB1P20700 TTPAL-203ENST00000372906 1139 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LMNB1P20700 MIR557-201ENST00000385239 98 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
LMNB1P20700 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LMNB1P20700 POLR2H-203ENST00000430783 1159 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LMNB1P20700 PSMD4P1-201ENST00000433951 1109 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
LMNB1P20700 AL365436.2-201ENST00000434112 526 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LMNB1P20700 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LMNB1P20700 AGPAT5P1-201ENST00000455855 1019 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
LMNB1P20700 AC107463.1-201ENST00000508605 667 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LMNB1P20700 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LMNB1P20700 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LMNB1P20700 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LMNB1P20700 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LMNB1P20700 SIGLEC18P-201ENST00000602271 909 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
LMNB1P20700 AC025262.2-201ENST00000623975 1056 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
LMNB1P20700 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LMNB1P20700 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LMNB1P20700 RBM4B-206ENST00000531036 1646 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LMNB1P20700 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LMNB1P20700 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LMNB1P20700 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LMNB1P20700 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
LMNB1P20700 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LMNB1P20700 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LMNB1P20700 LIPE-AS1-204ENST00000594624 1448 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LMNB1P20700 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LMNB1P20700 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LMNB1P20700 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LMNB1P20700 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LMNB1P20700 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LMNB1P20700 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LMNB1P20700 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LMNB1P20700 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LMNB1P20700 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LMNB1P20700 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LMNB1P20700 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LMNB1P20700 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LMNB1P20700 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LMNB1P20700 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LMNB1P20700 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LMNB1P20700 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LMNB1P20700 AC090502.4-201ENST00000551714 1386 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
LMNB1P20700 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LMNB1P20700 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LMNB1P20700 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LMNB1P20700 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
LMNB1P20700 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LMNB1P20700 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LMNB1P20700 SLC13A3-205ENST00000417157 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LMNB1P20700 BCAS2P2-201ENST00000425064 674 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
LMNB1P20700 HIGD1A-203ENST00000430190 741 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LMNB1P20700 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LMNB1P20700 DCST1-AS1-201ENST00000452962 822 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LMNB1P20700 AC245884.1-201ENST00000457113 529 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LMNB1P20700 PGAP2-212ENST00000464906 1259 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LMNB1P20700 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LMNB1P20700 MIR5196-201ENST00000578146 115 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
LMNB1P20700 AC093567.1-201ENST00000590649 877 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LMNB1P20700 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
LMNB1P20700 AC005618.3-201ENST00000624928 458 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
LMNB1P20700 LINC00431-202ENST00000636375 159 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
LMNB1P20700 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LMNB1P20700 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LMNB1P20700 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LMNB1P20700 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LMNB1P20700 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LMNB1P20700 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LMNB1P20700 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LMNB1P20700 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
LMNB1P20700 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
LMNB1P20700 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.3 ms