Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 SZRD1-203ENST00000471507 892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPRAP18433 AC104784.1-201ENST00000473096 294 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPRAP18433 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPRAP18433 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPRAP18433 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPRAP18433 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPRAP18433 MBP-227ENST00000526111 581 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPRAP18433 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPRAP18433 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPRAP18433 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPRAP18433 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPRAP18433 AP003419.4-201ENST00000616071 517 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPRAP18433 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPRAP18433 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPRAP18433 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPRAP18433 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPRAP18433 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPRAP18433 TBC1D3J-201ENST00000620719 1426 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPRAP18433 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPRAP18433 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPRAP18433 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPRAP18433 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPRAP18433 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPRAP18433 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPRAP18433 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPRAP18433 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPRAP18433 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPRAP18433 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPRAP18433 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPRAP18433 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPRAP18433 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPRAP18433 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPRAP18433 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPRAP18433 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPRAP18433 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPRAP18433 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPRAP18433 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPRAP18433 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPRAP18433 TNNT2-206ENST00000367320 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPRAP18433 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPRAP18433 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPRAP18433 LINC01006-202ENST00000418309 640 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPRAP18433 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPRAP18433 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPRAP18433 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPRAP18433 NR2F2-AS1-215ENST00000620029 1223 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPRAP18433 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPRAP18433 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPRAP18433 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPRAP18433 DNASE1L2-204ENST00000567494 1301 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPRAP18433 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPRAP18433 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPRAP18433 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPRAP18433 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPRAP18433 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPRAP18433 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPRAP18433 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPRAP18433 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPRAP18433 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPRAP18433 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPRAP18433 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPRAP18433 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPRAP18433 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPRAP18433 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPRAP18433 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPRAP18433 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPRAP18433 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPRAP18433 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPRAP18433 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPRAP18433 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPRAP18433 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPRAP18433 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPRAP18433 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPRAP18433 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPRAP18433 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPRAP18433 OR9I1-201ENST00000302610 945 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPRAP18433 SPDYE4-201ENST00000328794 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPRAP18433 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPRAP18433 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPRAP18433 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPRAP18433 AC105389.3-201ENST00000508038 907 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPRAP18433 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPRAP18433 AL031282.1-201ENST00000577672 409 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPRAP18433 WDR7-208ENST00000589935 544 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPRAP18433 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPRAP18433 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPRAP18433 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPRAP18433 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPRAP18433 CFAP36-201ENST00000339012 1373 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPRAP18433 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPRAP18433 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPRAP18433 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPRAP18433 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPRAP18433 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPRAP18433 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPRAP18433 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPRAP18433 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPRAP18433 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPRAP18433 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPRAP18433 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
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