Protein–RNA interactions for Protein: P17900

GM2A, Ganglioside GM2 activator, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GM2AP17900 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
GM2AP17900 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GM2AP17900 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GM2AP17900 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GM2AP17900 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GM2AP17900 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GM2AP17900 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GM2AP17900 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GM2AP17900 RLIM-202ENST00000349225 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GM2AP17900 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GM2AP17900 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GM2AP17900 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GM2AP17900 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GM2AP17900 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GM2AP17900 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GM2AP17900 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GM2AP17900 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GM2AP17900 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GM2AP17900 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GM2AP17900 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GM2AP17900 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GM2AP17900 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GM2AP17900 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GM2AP17900 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GM2AP17900 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GM2AP17900 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
GM2AP17900 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GM2AP17900 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GM2AP17900 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GM2AP17900 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
GM2AP17900 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GM2AP17900 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GM2AP17900 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GM2AP17900 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GM2AP17900 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GM2AP17900 THTPA-201ENST00000288014 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GM2AP17900 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GM2AP17900 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GM2AP17900 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GM2AP17900 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GM2AP17900 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GM2AP17900 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GM2AP17900 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GM2AP17900 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GM2AP17900 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GM2AP17900 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GM2AP17900 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GM2AP17900 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GM2AP17900 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GM2AP17900 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GM2AP17900 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GM2AP17900 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GM2AP17900 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GM2AP17900 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GM2AP17900 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GM2AP17900 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GM2AP17900 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GM2AP17900 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GM2AP17900 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GM2AP17900 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GM2AP17900 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GM2AP17900 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GM2AP17900 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GM2AP17900 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GM2AP17900 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GM2AP17900 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GM2AP17900 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GM2AP17900 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GM2AP17900 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GM2AP17900 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GM2AP17900 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GM2AP17900 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GM2AP17900 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GM2AP17900 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GM2AP17900 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GM2AP17900 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
GM2AP17900 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GM2AP17900 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GM2AP17900 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GM2AP17900 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GM2AP17900 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GM2AP17900 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GM2AP17900 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GM2AP17900 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GM2AP17900 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GM2AP17900 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GM2AP17900 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GM2AP17900 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GM2AP17900 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GM2AP17900 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GM2AP17900 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GM2AP17900 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GM2AP17900 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GM2AP17900 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GM2AP17900 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GM2AP17900 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GM2AP17900 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GM2AP17900 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
GM2AP17900 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GM2AP17900 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms