Protein–RNA interactions for Protein: P17483

HOXB4, Homeobox protein Hox-B4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB4P17483 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
HOXB4P17483 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
HOXB4P17483 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
HOXB4P17483 AC103691.2-201ENST00000618824 433 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
HOXB4P17483 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
HOXB4P17483 ARV1-201ENST00000310256 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
HOXB4P17483 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
HOXB4P17483 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
HOXB4P17483 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
HOXB4P17483 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
HOXB4P17483 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
HOXB4P17483 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
HOXB4P17483 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
HOXB4P17483 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
HOXB4P17483 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
HOXB4P17483 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
HOXB4P17483 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
HOXB4P17483 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
HOXB4P17483 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
HOXB4P17483 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
HOXB4P17483 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
HOXB4P17483 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
HOXB4P17483 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
HOXB4P17483 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
HOXB4P17483 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
HOXB4P17483 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
HOXB4P17483 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
HOXB4P17483 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
HOXB4P17483 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
HOXB4P17483 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
HOXB4P17483 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
HOXB4P17483 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
HOXB4P17483 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
HOXB4P17483 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
HOXB4P17483 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
HOXB4P17483 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
HOXB4P17483 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
HOXB4P17483 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
HOXB4P17483 NPPC-202ENST00000409852 1051 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
HOXB4P17483 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
HOXB4P17483 AL109935.1-201ENST00000413249 473 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
HOXB4P17483 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
HOXB4P17483 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
HOXB4P17483 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
HOXB4P17483 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
HOXB4P17483 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
HOXB4P17483 SIAH2-AS1-201ENST00000461943 441 ntTSL 4 BASIC12.75□□□□□ -0.37
HOXB4P17483 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
HOXB4P17483 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
HOXB4P17483 NSD1-211ENST00000511258 809 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
HOXB4P17483 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
HOXB4P17483 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
HOXB4P17483 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
HOXB4P17483 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC12.75□□□□□ -0.37
HOXB4P17483 SLC44A3-209ENST00000532427 1912 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
HOXB4P17483 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
HOXB4P17483 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
HOXB4P17483 ZNF124-206ENST00000543802 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
HOXB4P17483 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
HOXB4P17483 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
HOXB4P17483 AL022344.2-201ENST00000568976 968 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
HOXB4P17483 UPF3AP2-202ENST00000578315 730 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
HOXB4P17483 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
HOXB4P17483 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
HOXB4P17483 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
HOXB4P17483 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
HOXB4P17483 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
HOXB4P17483 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
HOXB4P17483 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
HOXB4P17483 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
HOXB4P17483 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
HOXB4P17483 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
HOXB4P17483 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
HOXB4P17483 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
HOXB4P17483 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
HOXB4P17483 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
HOXB4P17483 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
HOXB4P17483 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
HOXB4P17483 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
HOXB4P17483 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
HOXB4P17483 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
HOXB4P17483 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
HOXB4P17483 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
HOXB4P17483 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
HOXB4P17483 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
HOXB4P17483 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
HOXB4P17483 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
HOXB4P17483 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
HOXB4P17483 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
HOXB4P17483 SERF2-201ENST00000249786 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
HOXB4P17483 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
HOXB4P17483 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
HOXB4P17483 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
HOXB4P17483 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
HOXB4P17483 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
HOXB4P17483 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
HOXB4P17483 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
HOXB4P17483 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
HOXB4P17483 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
HOXB4P17483 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms