Protein–RNA interactions for Protein: P11926

ODC1, Ornithine decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1P11926 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ODC1P11926 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ODC1P11926 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ODC1P11926 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ODC1P11926 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ODC1P11926 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ODC1P11926 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ODC1P11926 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ODC1P11926 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ODC1P11926 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ODC1P11926 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ODC1P11926 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ODC1P11926 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ODC1P11926 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ODC1P11926 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ODC1P11926 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ODC1P11926 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ODC1P11926 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ODC1P11926 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ODC1P11926 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ODC1P11926 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ODC1P11926 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ODC1P11926 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ODC1P11926 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ODC1P11926 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ODC1P11926 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ODC1P11926 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ODC1P11926 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ODC1P11926 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ODC1P11926 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ODC1P11926 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ODC1P11926 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ODC1P11926 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ODC1P11926 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ODC1P11926 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ODC1P11926 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ODC1P11926 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ODC1P11926 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ODC1P11926 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ODC1P11926 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ODC1P11926 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ODC1P11926 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ODC1P11926 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ODC1P11926 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ODC1P11926 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ODC1P11926 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ODC1P11926 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ODC1P11926 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ODC1P11926 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ODC1P11926 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ODC1P11926 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ODC1P11926 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ODC1P11926 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ODC1P11926 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ODC1P11926 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ODC1P11926 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ODC1P11926 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ODC1P11926 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ODC1P11926 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ODC1P11926 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ODC1P11926 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ODC1P11926 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ODC1P11926 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ODC1P11926 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ODC1P11926 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ODC1P11926 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ODC1P11926 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ODC1P11926 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ODC1P11926 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ODC1P11926 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ODC1P11926 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ODC1P11926 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ODC1P11926 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ODC1P11926 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ODC1P11926 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ODC1P11926 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ODC1P11926 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ODC1P11926 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ODC1P11926 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ODC1P11926 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ODC1P11926 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ODC1P11926 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ODC1P11926 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ODC1P11926 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ODC1P11926 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ODC1P11926 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ODC1P11926 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ODC1P11926 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ODC1P11926 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ODC1P11926 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ODC1P11926 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ODC1P11926 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ODC1P11926 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ODC1P11926 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ODC1P11926 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ODC1P11926 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ODC1P11926 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ODC1P11926 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ODC1P11926 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ODC1P11926 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms