Protein–RNA interactions for Protein: P0C875

FAM228B, Protein FAM228B, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM228BP0C875 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FAM228BP0C875 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FAM228BP0C875 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FAM228BP0C875 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
FAM228BP0C875 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FAM228BP0C875 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FAM228BP0C875 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
FAM228BP0C875 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FAM228BP0C875 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FAM228BP0C875 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FAM228BP0C875 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FAM228BP0C875 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FAM228BP0C875 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FAM228BP0C875 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FAM228BP0C875 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FAM228BP0C875 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FAM228BP0C875 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FAM228BP0C875 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FAM228BP0C875 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FAM228BP0C875 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FAM228BP0C875 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FAM228BP0C875 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FAM228BP0C875 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FAM228BP0C875 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FAM228BP0C875 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FAM228BP0C875 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
FAM228BP0C875 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
FAM228BP0C875 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
FAM228BP0C875 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
FAM228BP0C875 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FAM228BP0C875 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
FAM228BP0C875 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FAM228BP0C875 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FAM228BP0C875 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FAM228BP0C875 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FAM228BP0C875 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FAM228BP0C875 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FAM228BP0C875 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FAM228BP0C875 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FAM228BP0C875 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FAM228BP0C875 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FAM228BP0C875 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FAM228BP0C875 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FAM228BP0C875 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM228BP0C875 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM228BP0C875 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM228BP0C875 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM228BP0C875 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM228BP0C875 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM228BP0C875 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM228BP0C875 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM228BP0C875 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM228BP0C875 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM228BP0C875 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM228BP0C875 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM228BP0C875 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM228BP0C875 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM228BP0C875 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM228BP0C875 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM228BP0C875 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM228BP0C875 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM228BP0C875 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM228BP0C875 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM228BP0C875 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM228BP0C875 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM228BP0C875 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM228BP0C875 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM228BP0C875 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM228BP0C875 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM228BP0C875 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM228BP0C875 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM228BP0C875 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM228BP0C875 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM228BP0C875 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM228BP0C875 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM228BP0C875 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM228BP0C875 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM228BP0C875 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM228BP0C875 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM228BP0C875 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM228BP0C875 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM228BP0C875 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM228BP0C875 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM228BP0C875 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM228BP0C875 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM228BP0C875 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM228BP0C875 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM228BP0C875 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM228BP0C875 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM228BP0C875 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FAM228BP0C875 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FAM228BP0C875 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FAM228BP0C875 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FAM228BP0C875 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FAM228BP0C875 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FAM228BP0C875 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FAM228BP0C875 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FAM228BP0C875 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FAM228BP0C875 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FAM228BP0C875 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.5 ms