Protein–RNA interactions for Protein: P0C0L5

C4B, Complement C4-B, humanhuman

Predictions only

Length 1,744 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4BP0C0L5 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
C4BP0C0L5 AC040162.4-201ENST00000574912 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
C4BP0C0L5 AC007326.1-201ENST00000604539 458 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
C4BP0C0L5 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
C4BP0C0L5 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
C4BP0C0L5 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
C4BP0C0L5 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
C4BP0C0L5 CSF2RA-219ENST00000501036 1622 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
C4BP0C0L5 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
C4BP0C0L5 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
C4BP0C0L5 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
C4BP0C0L5 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
C4BP0C0L5 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
C4BP0C0L5 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
C4BP0C0L5 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
C4BP0C0L5 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
C4BP0C0L5 RELL1-201ENST00000314117 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
C4BP0C0L5 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
C4BP0C0L5 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
C4BP0C0L5 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
C4BP0C0L5 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
C4BP0C0L5 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
C4BP0C0L5 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
C4BP0C0L5 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
C4BP0C0L5 AL606748.1-201ENST00000423919 655 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
C4BP0C0L5 POLR2H-203ENST00000430783 1159 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
C4BP0C0L5 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC18.8■□□□□ 0.6
C4BP0C0L5 PSMD4P1-201ENST00000433951 1109 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
C4BP0C0L5 BX276092.5-201ENST00000439926 886 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
C4BP0C0L5 CYB561D1-207ENST00000527072 892 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
C4BP0C0L5 AL355916.2-201ENST00000556543 593 ntTSL 4 BASIC18.8■□□□□ 0.6
C4BP0C0L5 AC051619.5-201ENST00000559003 736 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
C4BP0C0L5 AC138466.4-201ENST00000623965 852 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
C4BP0C0L5 AC009145.4-201ENST00000625119 1294 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
C4BP0C0L5 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
C4BP0C0L5 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
C4BP0C0L5 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
C4BP0C0L5 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
C4BP0C0L5 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
C4BP0C0L5 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
C4BP0C0L5 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
C4BP0C0L5 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
C4BP0C0L5 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
C4BP0C0L5 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
C4BP0C0L5 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
C4BP0C0L5 CTNNBIP1-201ENST00000377256 451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
C4BP0C0L5 AZGP1P1-202ENST00000425474 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
C4BP0C0L5 MYL7-209ENST00000458240 791 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
C4BP0C0L5 AC114947.1-202ENST00000514136 344 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
C4BP0C0L5 ALG1L6P-201ENST00000515248 758 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
C4BP0C0L5 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
C4BP0C0L5 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
C4BP0C0L5 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
C4BP0C0L5 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
C4BP0C0L5 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
C4BP0C0L5 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
C4BP0C0L5 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
C4BP0C0L5 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
C4BP0C0L5 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
C4BP0C0L5 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
C4BP0C0L5 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
C4BP0C0L5 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
C4BP0C0L5 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
C4BP0C0L5 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
C4BP0C0L5 SPIN2B-203ENST00000374910 725 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
C4BP0C0L5 AL139241.1-201ENST00000433374 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
C4BP0C0L5 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
C4BP0C0L5 FRMD4A-208ENST00000493380 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
C4BP0C0L5 ALG1L13P-202ENST00000519320 584 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
C4BP0C0L5 AC069185.1-202ENST00000533405 471 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
C4BP0C0L5 MIR3180-2-201ENST00000581748 88 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
C4BP0C0L5 AC138466.5-201ENST00000624002 808 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
C4BP0C0L5 GLUD1P2-203ENST00000631118 486 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
C4BP0C0L5 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
C4BP0C0L5 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
C4BP0C0L5 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
C4BP0C0L5 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
C4BP0C0L5 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
C4BP0C0L5 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
C4BP0C0L5 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
C4BP0C0L5 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
C4BP0C0L5 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
C4BP0C0L5 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
C4BP0C0L5 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
C4BP0C0L5 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
C4BP0C0L5 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
C4BP0C0L5 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
C4BP0C0L5 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
C4BP0C0L5 EDNRB-204ENST00000626030 1571 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
C4BP0C0L5 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
C4BP0C0L5 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
C4BP0C0L5 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
C4BP0C0L5 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
C4BP0C0L5 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
C4BP0C0L5 CCDC169-SOHLH2-201ENST00000511166 2051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
C4BP0C0L5 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
C4BP0C0L5 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
C4BP0C0L5 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
C4BP0C0L5 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
C4BP0C0L5 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
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