Protein–RNA interactions for Protein: P06400

RB1, Retinoblastoma-associated protein, humanhuman

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Length 928 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RB1P06400 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RB1P06400 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RB1P06400 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RB1P06400 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RB1P06400 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
RB1P06400 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RB1P06400 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RB1P06400 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RB1P06400 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RB1P06400 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RB1P06400 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RB1P06400 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RB1P06400 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RB1P06400 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RB1P06400 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RB1P06400 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RB1P06400 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RB1P06400 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RB1P06400 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RB1P06400 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RB1P06400 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RB1P06400 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RB1P06400 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RB1P06400 ANK1-203ENST00000314214 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RB1P06400 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RB1P06400 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RB1P06400 MRPL19-201ENST00000358788 693 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RB1P06400 SMIM29-202ENST00000394990 792 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RB1P06400 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RB1P06400 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RB1P06400 IDI2-AS1-201ENST00000420381 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RB1P06400 HPGD-203ENST00000422112 805 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RB1P06400 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RB1P06400 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RB1P06400 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RB1P06400 FKBP2-203ENST00000449942 613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RB1P06400 AC133961.1-201ENST00000503085 762 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RB1P06400 AL049795.2-201ENST00000515055 667 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RB1P06400 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RB1P06400 TMEM231-206ENST00000565067 1078 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RB1P06400 ERVK13-1-204ENST00000566343 567 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RB1P06400 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RB1P06400 IMPA2-207ENST00000588927 787 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RB1P06400 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RB1P06400 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RB1P06400 EXOSC5-204ENST00000596905 826 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RB1P06400 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RB1P06400 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RB1P06400 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RB1P06400 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RB1P06400 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RB1P06400 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RB1P06400 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RB1P06400 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RB1P06400 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RB1P06400 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RB1P06400 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RB1P06400 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RB1P06400 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RB1P06400 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RB1P06400 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RB1P06400 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RB1P06400 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RB1P06400 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RB1P06400 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RB1P06400 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RB1P06400 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RB1P06400 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RB1P06400 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RB1P06400 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RB1P06400 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RB1P06400 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RB1P06400 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RB1P06400 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RB1P06400 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RB1P06400 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RB1P06400 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RB1P06400 IL1R2-203ENST00000441002 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RB1P06400 AC130709.1-201ENST00000484779 1212 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RB1P06400 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RB1P06400 RBM4B-202ENST00000524637 867 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RB1P06400 TMEM218-205ENST00000527271 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RB1P06400 CFL1-206ENST00000527344 962 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RB1P06400 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RB1P06400 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RB1P06400 AC025154.2-203ENST00000550214 1031 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RB1P06400 FKBP11-212ENST00000552878 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RB1P06400 TPM1-223ENST00000560445 485 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RB1P06400 AC026803.1-201ENST00000569130 274 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RB1P06400 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RB1P06400 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RB1P06400 CNOT7-213ENST00000628418 432 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RB1P06400 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RB1P06400 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RB1P06400 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RB1P06400 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RB1P06400 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RB1P06400 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RB1P06400 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RB1P06400 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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