Protein–RNA interactions for Protein: O95343

SIX3, Homeobox protein SIX3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX3O95343 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SIX3O95343 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SIX3O95343 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SIX3O95343 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SIX3O95343 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SIX3O95343 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SIX3O95343 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SIX3O95343 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
SIX3O95343 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SIX3O95343 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SIX3O95343 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SIX3O95343 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SIX3O95343 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SIX3O95343 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SIX3O95343 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SIX3O95343 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SIX3O95343 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SIX3O95343 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SIX3O95343 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SIX3O95343 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SIX3O95343 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SIX3O95343 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SIX3O95343 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SIX3O95343 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
SIX3O95343 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SIX3O95343 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SIX3O95343 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
SIX3O95343 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SIX3O95343 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
SIX3O95343 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SIX3O95343 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SIX3O95343 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SIX3O95343 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SIX3O95343 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
SIX3O95343 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SIX3O95343 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SIX3O95343 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SIX3O95343 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SIX3O95343 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SIX3O95343 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SIX3O95343 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SIX3O95343 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SIX3O95343 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SIX3O95343 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SIX3O95343 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SIX3O95343 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SIX3O95343 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SIX3O95343 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
SIX3O95343 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SIX3O95343 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SIX3O95343 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SIX3O95343 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SIX3O95343 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SIX3O95343 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SIX3O95343 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SIX3O95343 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SIX3O95343 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SIX3O95343 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SIX3O95343 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SIX3O95343 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SIX3O95343 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SIX3O95343 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SIX3O95343 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SIX3O95343 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SIX3O95343 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SIX3O95343 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SIX3O95343 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SIX3O95343 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SIX3O95343 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SIX3O95343 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SIX3O95343 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SIX3O95343 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SIX3O95343 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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SIX3O95343 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SIX3O95343 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SIX3O95343 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SIX3O95343 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SIX3O95343 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SIX3O95343 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SIX3O95343 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SIX3O95343 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SIX3O95343 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SIX3O95343 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SIX3O95343 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SIX3O95343 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SIX3O95343 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SIX3O95343 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SIX3O95343 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SIX3O95343 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SIX3O95343 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SIX3O95343 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SIX3O95343 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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