Protein–RNA interactions for Protein: O95273

CCNDBP1, Cyclin-D1-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1O95273 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CCNDBP1O95273 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CCNDBP1O95273 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
CCNDBP1O95273 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
CCNDBP1O95273 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CCNDBP1O95273 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CCNDBP1O95273 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CCNDBP1O95273 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CCNDBP1O95273 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
CCNDBP1O95273 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CCNDBP1O95273 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CCNDBP1O95273 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CCNDBP1O95273 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CCNDBP1O95273 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
CCNDBP1O95273 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CCNDBP1O95273 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CCNDBP1O95273 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
CCNDBP1O95273 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CCNDBP1O95273 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CCNDBP1O95273 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CCNDBP1O95273 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CCNDBP1O95273 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CCNDBP1O95273 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CCNDBP1O95273 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
CCNDBP1O95273 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CCNDBP1O95273 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CCNDBP1O95273 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CCNDBP1O95273 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CCNDBP1O95273 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CCNDBP1O95273 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CCNDBP1O95273 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CCNDBP1O95273 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CCNDBP1O95273 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CCNDBP1O95273 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CCNDBP1O95273 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CCNDBP1O95273 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CCNDBP1O95273 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CCNDBP1O95273 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
CCNDBP1O95273 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CCNDBP1O95273 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CCNDBP1O95273 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CCNDBP1O95273 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CCNDBP1O95273 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CCNDBP1O95273 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CCNDBP1O95273 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CCNDBP1O95273 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CCNDBP1O95273 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CCNDBP1O95273 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CCNDBP1O95273 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CCNDBP1O95273 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
CCNDBP1O95273 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
CCNDBP1O95273 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CCNDBP1O95273 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CCNDBP1O95273 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CCNDBP1O95273 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CCNDBP1O95273 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CCNDBP1O95273 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CCNDBP1O95273 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CCNDBP1O95273 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CCNDBP1O95273 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CCNDBP1O95273 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
CCNDBP1O95273 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CCNDBP1O95273 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CCNDBP1O95273 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CCNDBP1O95273 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CCNDBP1O95273 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CCNDBP1O95273 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CCNDBP1O95273 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CCNDBP1O95273 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CCNDBP1O95273 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CCNDBP1O95273 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CCNDBP1O95273 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CCNDBP1O95273 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CCNDBP1O95273 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CCNDBP1O95273 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CCNDBP1O95273 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CCNDBP1O95273 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CCNDBP1O95273 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CCNDBP1O95273 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CCNDBP1O95273 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CCNDBP1O95273 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CCNDBP1O95273 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCNDBP1O95273 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCNDBP1O95273 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCNDBP1O95273 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCNDBP1O95273 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCNDBP1O95273 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCNDBP1O95273 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCNDBP1O95273 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCNDBP1O95273 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCNDBP1O95273 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCNDBP1O95273 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCNDBP1O95273 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCNDBP1O95273 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCNDBP1O95273 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCNDBP1O95273 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCNDBP1O95273 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCNDBP1O95273 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCNDBP1O95273 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCNDBP1O95273 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 642.8 ms