Protein–RNA interactions for Protein: O43900

PRICKLE3, Prickle planar cell polarity protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 615 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRICKLE3O43900 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PRICKLE3O43900 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PRICKLE3O43900 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
PRICKLE3O43900 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PRICKLE3O43900 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PRICKLE3O43900 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PRICKLE3O43900 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PRICKLE3O43900 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PRICKLE3O43900 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PRICKLE3O43900 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PRICKLE3O43900 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PRICKLE3O43900 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PRICKLE3O43900 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PRICKLE3O43900 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PRICKLE3O43900 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
PRICKLE3O43900 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PRICKLE3O43900 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PRICKLE3O43900 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PRICKLE3O43900 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRICKLE3O43900 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRICKLE3O43900 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRICKLE3O43900 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRICKLE3O43900 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRICKLE3O43900 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRICKLE3O43900 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRICKLE3O43900 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRICKLE3O43900 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PRICKLE3O43900 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRICKLE3O43900 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRICKLE3O43900 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRICKLE3O43900 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRICKLE3O43900 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRICKLE3O43900 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRICKLE3O43900 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRICKLE3O43900 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRICKLE3O43900 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRICKLE3O43900 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRICKLE3O43900 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PRICKLE3O43900 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRICKLE3O43900 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PRICKLE3O43900 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PRICKLE3O43900 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRICKLE3O43900 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRICKLE3O43900 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PRICKLE3O43900 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRICKLE3O43900 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRICKLE3O43900 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRICKLE3O43900 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PRICKLE3O43900 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PRICKLE3O43900 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PRICKLE3O43900 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRICKLE3O43900 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRICKLE3O43900 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRICKLE3O43900 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRICKLE3O43900 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRICKLE3O43900 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRICKLE3O43900 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRICKLE3O43900 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRICKLE3O43900 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRICKLE3O43900 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRICKLE3O43900 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRICKLE3O43900 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRICKLE3O43900 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRICKLE3O43900 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRICKLE3O43900 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRICKLE3O43900 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRICKLE3O43900 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRICKLE3O43900 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRICKLE3O43900 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRICKLE3O43900 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRICKLE3O43900 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRICKLE3O43900 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRICKLE3O43900 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRICKLE3O43900 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRICKLE3O43900 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRICKLE3O43900 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRICKLE3O43900 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRICKLE3O43900 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRICKLE3O43900 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRICKLE3O43900 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRICKLE3O43900 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRICKLE3O43900 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRICKLE3O43900 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRICKLE3O43900 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRICKLE3O43900 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRICKLE3O43900 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRICKLE3O43900 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRICKLE3O43900 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PRICKLE3O43900 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRICKLE3O43900 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRICKLE3O43900 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PRICKLE3O43900 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRICKLE3O43900 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRICKLE3O43900 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRICKLE3O43900 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRICKLE3O43900 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRICKLE3O43900 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRICKLE3O43900 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRICKLE3O43900 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRICKLE3O43900 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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