Protein–RNA interactions for Protein: O43731

KDELR3, ER lumen protein-retaining receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDELR3O43731 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
KDELR3O43731 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KDELR3O43731 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KDELR3O43731 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KDELR3O43731 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KDELR3O43731 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KDELR3O43731 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KDELR3O43731 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KDELR3O43731 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KDELR3O43731 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
KDELR3O43731 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
KDELR3O43731 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
KDELR3O43731 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
KDELR3O43731 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
KDELR3O43731 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KDELR3O43731 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KDELR3O43731 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KDELR3O43731 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KDELR3O43731 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KDELR3O43731 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KDELR3O43731 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KDELR3O43731 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KDELR3O43731 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KDELR3O43731 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KDELR3O43731 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KDELR3O43731 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KDELR3O43731 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KDELR3O43731 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KDELR3O43731 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KDELR3O43731 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KDELR3O43731 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KDELR3O43731 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KDELR3O43731 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KDELR3O43731 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KDELR3O43731 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KDELR3O43731 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KDELR3O43731 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KDELR3O43731 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KDELR3O43731 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KDELR3O43731 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KDELR3O43731 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KDELR3O43731 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KDELR3O43731 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KDELR3O43731 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KDELR3O43731 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KDELR3O43731 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KDELR3O43731 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KDELR3O43731 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
KDELR3O43731 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KDELR3O43731 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KDELR3O43731 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KDELR3O43731 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KDELR3O43731 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KDELR3O43731 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
KDELR3O43731 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KDELR3O43731 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KDELR3O43731 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
KDELR3O43731 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KDELR3O43731 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KDELR3O43731 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KDELR3O43731 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KDELR3O43731 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KDELR3O43731 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KDELR3O43731 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KDELR3O43731 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KDELR3O43731 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KDELR3O43731 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KDELR3O43731 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KDELR3O43731 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KDELR3O43731 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KDELR3O43731 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
KDELR3O43731 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KDELR3O43731 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KDELR3O43731 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KDELR3O43731 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KDELR3O43731 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KDELR3O43731 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KDELR3O43731 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KDELR3O43731 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KDELR3O43731 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KDELR3O43731 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KDELR3O43731 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KDELR3O43731 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KDELR3O43731 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KDELR3O43731 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KDELR3O43731 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KDELR3O43731 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KDELR3O43731 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KDELR3O43731 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KDELR3O43731 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KDELR3O43731 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KDELR3O43731 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KDELR3O43731 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KDELR3O43731 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KDELR3O43731 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KDELR3O43731 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KDELR3O43731 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KDELR3O43731 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KDELR3O43731 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KDELR3O43731 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms