Protein–RNA interactions for Protein: O43583

DENR, Density-regulated protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENRO43583 SSTR3-201ENST00000610913 4100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
DENRO43583 SLC4A7-214ENST00000455077 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
DENRO43583 TMEM87A-201ENST00000307216 1598 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
DENRO43583 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
DENRO43583 ARMC5-201ENST00000268314 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
DENRO43583 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
DENRO43583 SCARB2-227ENST00000640957 3255 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
DENRO43583 ADAM33-201ENST00000350009 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
DENRO43583 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
DENRO43583 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
DENRO43583 ARHGAP45-206ENST00000586866 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
DENRO43583 RGMA-204ENST00000543599 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
DENRO43583 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
DENRO43583 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
DENRO43583 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
DENRO43583 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
DENRO43583 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
DENRO43583 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
DENRO43583 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
DENRO43583 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
DENRO43583 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
DENRO43583 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
DENRO43583 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
DENRO43583 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
DENRO43583 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
DENRO43583 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
DENRO43583 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
DENRO43583 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
DENRO43583 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
DENRO43583 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
DENRO43583 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
DENRO43583 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
DENRO43583 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
DENRO43583 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
DENRO43583 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
DENRO43583 TTC14-202ENST00000382584 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
DENRO43583 SACM1L-201ENST00000389061 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
DENRO43583 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
DENRO43583 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
DENRO43583 MKRN1-201ENST00000255977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
DENRO43583 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
DENRO43583 PDK2-203ENST00000503176 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
DENRO43583 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
DENRO43583 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
DENRO43583 HSPH1-202ENST00000380405 3480 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
DENRO43583 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
DENRO43583 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
DENRO43583 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
DENRO43583 POTEM-201ENST00000547889 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
DENRO43583 FAM213A-203ENST00000372187 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
DENRO43583 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
DENRO43583 C1QTNF1-203ENST00000354124 2714 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.08□□□□□ -0.15
DENRO43583 TNFAIP8L1-201ENST00000327473 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
DENRO43583 TNFAIP8L1-202ENST00000536716 3845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.15
DENRO43583 KANK2-205ENST00000589359 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
DENRO43583 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
DENRO43583 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
DENRO43583 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
DENRO43583 CAPN14-202ENST00000403897 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
DENRO43583 AC051649.2-201ENST00000640310 3319 ntAPPRIS P1 BASIC14.08□□□□□ -0.16
DENRO43583 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
DENRO43583 NOB1-201ENST00000268802 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
DENRO43583 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
DENRO43583 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
DENRO43583 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
DENRO43583 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
DENRO43583 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
DENRO43583 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
DENRO43583 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
DENRO43583 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
DENRO43583 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
DENRO43583 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
DENRO43583 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
DENRO43583 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
DENRO43583 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
DENRO43583 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC14.08□□□□□ -0.16
DENRO43583 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
DENRO43583 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
DENRO43583 ADAMTS7P1-201ENST00000613213 4793 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
DENRO43583 GEM-201ENST00000297596 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
DENRO43583 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
DENRO43583 ZFP36L2-201ENST00000282388 3696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
DENRO43583 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
DENRO43583 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
DENRO43583 DDC-207ENST00000444124 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
DENRO43583 ZNF135-205ENST00000511556 2253 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
DENRO43583 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
DENRO43583 LAMP2-203ENST00000434600 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
DENRO43583 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
DENRO43583 TASP1-201ENST00000337743 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
DENRO43583 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
DENRO43583 C12orf43-202ENST00000445832 2397 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
DENRO43583 TICAM1-201ENST00000248244 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
DENRO43583 ATP2C1-201ENST00000328560 3484 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
DENRO43583 TBC1D8-AS1-201ENST00000610202 2478 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
DENRO43583 LDHAL6A-201ENST00000280706 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
DENRO43583 MAGED4B-201ENST00000335504 2578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
DENRO43583 NR4A1-202ENST00000360284 2589 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
DENRO43583 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
DENRO43583 TOE1-201ENST00000372090 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms