Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Length 516 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
LRRTM2O43300 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
LRRTM2O43300 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
LRRTM2O43300 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
LRRTM2O43300 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
LRRTM2O43300 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
LRRTM2O43300 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
LRRTM2O43300 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
LRRTM2O43300 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
LRRTM2O43300 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
LRRTM2O43300 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
LRRTM2O43300 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
LRRTM2O43300 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
LRRTM2O43300 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
LRRTM2O43300 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
LRRTM2O43300 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
LRRTM2O43300 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
LRRTM2O43300 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
LRRTM2O43300 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
LRRTM2O43300 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
LRRTM2O43300 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
LRRTM2O43300 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
LRRTM2O43300 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
LRRTM2O43300 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
LRRTM2O43300 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
LRRTM2O43300 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
LRRTM2O43300 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
LRRTM2O43300 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
LRRTM2O43300 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
LRRTM2O43300 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
LRRTM2O43300 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
LRRTM2O43300 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
LRRTM2O43300 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
LRRTM2O43300 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
LRRTM2O43300 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
LRRTM2O43300 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
LRRTM2O43300 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
LRRTM2O43300 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
LRRTM2O43300 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
LRRTM2O43300 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
LRRTM2O43300 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
LRRTM2O43300 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
LRRTM2O43300 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
LRRTM2O43300 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
LRRTM2O43300 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
LRRTM2O43300 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
LRRTM2O43300 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
LRRTM2O43300 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
LRRTM2O43300 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
LRRTM2O43300 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
LRRTM2O43300 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
LRRTM2O43300 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
LRRTM2O43300 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
LRRTM2O43300 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
LRRTM2O43300 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
LRRTM2O43300 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
LRRTM2O43300 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
LRRTM2O43300 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
LRRTM2O43300 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
LRRTM2O43300 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
LRRTM2O43300 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
LRRTM2O43300 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
LRRTM2O43300 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
LRRTM2O43300 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
LRRTM2O43300 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
LRRTM2O43300 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
LRRTM2O43300 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC14.33□□□□□ -0.12
LRRTM2O43300 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
LRRTM2O43300 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
LRRTM2O43300 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
LRRTM2O43300 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
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LRRTM2O43300 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
LRRTM2O43300 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
LRRTM2O43300 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
LRRTM2O43300 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
LRRTM2O43300 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
LRRTM2O43300 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
LRRTM2O43300 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
LRRTM2O43300 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
LRRTM2O43300 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
LRRTM2O43300 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
LRRTM2O43300 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
LRRTM2O43300 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
LRRTM2O43300 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
LRRTM2O43300 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
LRRTM2O43300 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
LRRTM2O43300 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
LRRTM2O43300 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
LRRTM2O43300 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
LRRTM2O43300 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
LRRTM2O43300 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
LRRTM2O43300 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
LRRTM2O43300 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
LRRTM2O43300 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
LRRTM2O43300 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
LRRTM2O43300 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
LRRTM2O43300 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
LRRTM2O43300 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
LRRTM2O43300 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
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