Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.7 ms