Protein–RNA interactions for Protein: A5PL33

KRBA1, Protein KRBA1, humanhuman

Predictions only

Length 1,030 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRBA1A5PL33 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KRBA1A5PL33 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KRBA1A5PL33 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KRBA1A5PL33 TCL1B-201ENST00000340722 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KRBA1A5PL33 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KRBA1A5PL33 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KRBA1A5PL33 CD1E-202ENST00000368155 696 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KRBA1A5PL33 CD1E-204ENST00000368157 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KRBA1A5PL33 AC007952.2-201ENST00000399091 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KRBA1A5PL33 AL355334.1-201ENST00000417713 215 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
KRBA1A5PL33 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
KRBA1A5PL33 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KRBA1A5PL33 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
KRBA1A5PL33 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
KRBA1A5PL33 SAP25-201ENST00000538735 837 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KRBA1A5PL33 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
KRBA1A5PL33 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KRBA1A5PL33 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KRBA1A5PL33 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KRBA1A5PL33 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KRBA1A5PL33 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KRBA1A5PL33 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KRBA1A5PL33 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KRBA1A5PL33 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KRBA1A5PL33 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KRBA1A5PL33 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KRBA1A5PL33 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KRBA1A5PL33 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KRBA1A5PL33 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KRBA1A5PL33 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KRBA1A5PL33 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KRBA1A5PL33 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KRBA1A5PL33 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KRBA1A5PL33 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KRBA1A5PL33 LHFPL3-201ENST00000401970 1378 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KRBA1A5PL33 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
KRBA1A5PL33 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KRBA1A5PL33 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KRBA1A5PL33 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KRBA1A5PL33 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KRBA1A5PL33 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KRBA1A5PL33 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KRBA1A5PL33 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KRBA1A5PL33 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KRBA1A5PL33 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KRBA1A5PL33 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KRBA1A5PL33 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KRBA1A5PL33 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KRBA1A5PL33 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KRBA1A5PL33 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KRBA1A5PL33 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KRBA1A5PL33 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KRBA1A5PL33 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KRBA1A5PL33 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KRBA1A5PL33 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KRBA1A5PL33 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
KRBA1A5PL33 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KRBA1A5PL33 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KRBA1A5PL33 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KRBA1A5PL33 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KRBA1A5PL33 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KRBA1A5PL33 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KRBA1A5PL33 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
KRBA1A5PL33 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KRBA1A5PL33 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
KRBA1A5PL33 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KRBA1A5PL33 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KRBA1A5PL33 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KRBA1A5PL33 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KRBA1A5PL33 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KRBA1A5PL33 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KRBA1A5PL33 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KRBA1A5PL33 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KRBA1A5PL33 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KRBA1A5PL33 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KRBA1A5PL33 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KRBA1A5PL33 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KRBA1A5PL33 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KRBA1A5PL33 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KRBA1A5PL33 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KRBA1A5PL33 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KRBA1A5PL33 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KRBA1A5PL33 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KRBA1A5PL33 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KRBA1A5PL33 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KRBA1A5PL33 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KRBA1A5PL33 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KRBA1A5PL33 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KRBA1A5PL33 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KRBA1A5PL33 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KRBA1A5PL33 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KRBA1A5PL33 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KRBA1A5PL33 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KRBA1A5PL33 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KRBA1A5PL33 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KRBA1A5PL33 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KRBA1A5PL33 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KRBA1A5PL33 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KRBA1A5PL33 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KRBA1A5PL33 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.1 ms