Protein–RNA interactions for Protein: R4GMW8

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BIVM-ERCC5R4GMW8 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
BIVM-ERCC5R4GMW8 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
BIVM-ERCC5R4GMW8 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
BIVM-ERCC5R4GMW8 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
BIVM-ERCC5R4GMW8 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
BIVM-ERCC5R4GMW8 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
BIVM-ERCC5R4GMW8 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
BIVM-ERCC5R4GMW8 PCBP1-AS1-214ENST00000419542 1309 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
BIVM-ERCC5R4GMW8 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
BIVM-ERCC5R4GMW8 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
BIVM-ERCC5R4GMW8 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
BIVM-ERCC5R4GMW8 HFE-201ENST00000309234 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
BIVM-ERCC5R4GMW8 CD164-210ENST00000512821 964 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
BIVM-ERCC5R4GMW8 TMEM14C-205ENST00000541412 1177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
BIVM-ERCC5R4GMW8 PIN1-207ENST00000588695 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC011500.3-201ENST00000594676 647 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
BIVM-ERCC5R4GMW8 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
BIVM-ERCC5R4GMW8 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
BIVM-ERCC5R4GMW8 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
BIVM-ERCC5R4GMW8 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
BIVM-ERCC5R4GMW8 EDNRB-204ENST00000626030 1571 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
BIVM-ERCC5R4GMW8 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
BIVM-ERCC5R4GMW8 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
BIVM-ERCC5R4GMW8 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
BIVM-ERCC5R4GMW8 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
BIVM-ERCC5R4GMW8 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
BIVM-ERCC5R4GMW8 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
BIVM-ERCC5R4GMW8 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
BIVM-ERCC5R4GMW8 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
BIVM-ERCC5R4GMW8 IL9RP3-201ENST00000442856 1674 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
BIVM-ERCC5R4GMW8 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
BIVM-ERCC5R4GMW8 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
BIVM-ERCC5R4GMW8 HPGD-203ENST00000422112 805 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC097065.1-201ENST00000425737 517 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC145207.8-201ENST00000580897 563 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC007326.1-201ENST00000604539 458 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
BIVM-ERCC5R4GMW8 MAP2K6-205ENST00000589647 1512 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
BIVM-ERCC5R4GMW8 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
BIVM-ERCC5R4GMW8 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
BIVM-ERCC5R4GMW8 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
BIVM-ERCC5R4GMW8 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
BIVM-ERCC5R4GMW8 LINC01815-202ENST00000641468 1409 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
BIVM-ERCC5R4GMW8 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
BIVM-ERCC5R4GMW8 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
BIVM-ERCC5R4GMW8 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
BIVM-ERCC5R4GMW8 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
BIVM-ERCC5R4GMW8 OR2V1-201ENST00000329365 948 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
BIVM-ERCC5R4GMW8 LYPLA2P1-203ENST00000447689 696 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC018463.1-201ENST00000456674 917 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
BIVM-ERCC5R4GMW8 OR2T27-202ENST00000460972 1136 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
BIVM-ERCC5R4GMW8 UPK1B-205ENST00000497685 981 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
BIVM-ERCC5R4GMW8 TCL1A-205ENST00000555202 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
BIVM-ERCC5R4GMW8 NUDT4P2-201ENST00000578341 546 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
BIVM-ERCC5R4GMW8 AP005901.3-201ENST00000581666 415 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
BIVM-ERCC5R4GMW8 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
BIVM-ERCC5R4GMW8 LINC01224-201ENST00000593573 798 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZNF528-AS1-202ENST00000596746 929 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
BIVM-ERCC5R4GMW8 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
BIVM-ERCC5R4GMW8 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
BIVM-ERCC5R4GMW8 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
BIVM-ERCC5R4GMW8 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
BIVM-ERCC5R4GMW8 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
BIVM-ERCC5R4GMW8 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
BIVM-ERCC5R4GMW8 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
BIVM-ERCC5R4GMW8 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
BIVM-ERCC5R4GMW8 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
BIVM-ERCC5R4GMW8 BGLAP-201ENST00000368272 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
BIVM-ERCC5R4GMW8 AK1-202ENST00000373156 757 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
BIVM-ERCC5R4GMW8 RPS9-204ENST00000391753 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
BIVM-ERCC5R4GMW8 PIN4P1-201ENST00000451079 396 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC084030.1-201ENST00000455068 561 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
BIVM-ERCC5R4GMW8 MPZL3-203ENST00000525386 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC069185.1-202ENST00000533405 471 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
BIVM-ERCC5R4GMW8 MESP2-203ENST00000560219 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
BIVM-ERCC5R4GMW8 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
BIVM-ERCC5R4GMW8 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
BIVM-ERCC5R4GMW8 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
BIVM-ERCC5R4GMW8 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
BIVM-ERCC5R4GMW8 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
BIVM-ERCC5R4GMW8 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
BIVM-ERCC5R4GMW8 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
BIVM-ERCC5R4GMW8 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
BIVM-ERCC5R4GMW8 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
BIVM-ERCC5R4GMW8 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
BIVM-ERCC5R4GMW8 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
BIVM-ERCC5R4GMW8 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
BIVM-ERCC5R4GMW8 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
BIVM-ERCC5R4GMW8 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
BIVM-ERCC5R4GMW8 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
BIVM-ERCC5R4GMW8 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
BIVM-ERCC5R4GMW8 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
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