Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5R8

TRAPPC1, Trafficking protein particle complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC1Q9Y5R8 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
TRAPPC1Q9Y5R8 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC11.58□□□□□ -0.56
TRAPPC1Q9Y5R8 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
TRAPPC1Q9Y5R8 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
TRAPPC1Q9Y5R8 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
TRAPPC1Q9Y5R8 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
TRAPPC1Q9Y5R8 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
TRAPPC1Q9Y5R8 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
TRAPPC1Q9Y5R8 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
TRAPPC1Q9Y5R8 AC105345.1-202ENST00000382488 3204 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
TRAPPC1Q9Y5R8 TMEM25-204ENST00000359862 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
TRAPPC1Q9Y5R8 TTK-201ENST00000230510 3477 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
TRAPPC1Q9Y5R8 LINC01341-202ENST00000421003 2600 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
TRAPPC1Q9Y5R8 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
TRAPPC1Q9Y5R8 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
TRAPPC1Q9Y5R8 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
TRAPPC1Q9Y5R8 DCDC2-202ENST00000378454 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
TRAPPC1Q9Y5R8 KAZN-205ENST00000400798 3643 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
TRAPPC1Q9Y5R8 MECOM-206ENST00000464456 5732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
TRAPPC1Q9Y5R8 ATG9A-204ENST00000409422 2512 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
TRAPPC1Q9Y5R8 PCDHGA5-201ENST00000518069 4602 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
TRAPPC1Q9Y5R8 FOXP3-204ENST00000455775 2448 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
TRAPPC1Q9Y5R8 CTR9-201ENST00000361367 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
TRAPPC1Q9Y5R8 MKL1-203ENST00000402042 4343 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
TRAPPC1Q9Y5R8 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
TRAPPC1Q9Y5R8 NRROS-201ENST00000328557 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
TRAPPC1Q9Y5R8 DYNC1I2-203ENST00000409197 2572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
TRAPPC1Q9Y5R8 DYNC1I2-206ENST00000409773 2583 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
TRAPPC1Q9Y5R8 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
TRAPPC1Q9Y5R8 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
TRAPPC1Q9Y5R8 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
TRAPPC1Q9Y5R8 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
TRAPPC1Q9Y5R8 PID1-202ENST00000392054 2745 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
TRAPPC1Q9Y5R8 COL6A2-203ENST00000397763 3101 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
TRAPPC1Q9Y5R8 SPOUT1-201ENST00000361256 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
TRAPPC1Q9Y5R8 SUN2-201ENST00000405018 4022 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
TRAPPC1Q9Y5R8 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
TRAPPC1Q9Y5R8 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
TRAPPC1Q9Y5R8 DAB2IP-202ENST00000309989 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
TRAPPC1Q9Y5R8 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
TRAPPC1Q9Y5R8 AGAP5-201ENST00000374094 2394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
TRAPPC1Q9Y5R8 MEAF6-204ENST00000373075 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
TRAPPC1Q9Y5R8 SPG11-202ENST00000427534 6935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
TRAPPC1Q9Y5R8 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
TRAPPC1Q9Y5R8 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
TRAPPC1Q9Y5R8 SLC25A26-202ENST00000354883 2673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
TRAPPC1Q9Y5R8 NSD2-203ENST00000382888 2666 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
TRAPPC1Q9Y5R8 CACNA1C-209ENST00000399603 7377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
TRAPPC1Q9Y5R8 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
TRAPPC1Q9Y5R8 RMDN1-201ENST00000406452 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
TRAPPC1Q9Y5R8 COL16A1-202ENST00000373668 3643 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
TRAPPC1Q9Y5R8 CAPN14-202ENST00000403897 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
TRAPPC1Q9Y5R8 TFEB-205ENST00000394283 2595 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
TRAPPC1Q9Y5R8 DLL4-201ENST00000249749 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
TRAPPC1Q9Y5R8 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
TRAPPC1Q9Y5R8 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
TRAPPC1Q9Y5R8 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
TRAPPC1Q9Y5R8 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
TRAPPC1Q9Y5R8 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
TRAPPC1Q9Y5R8 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
TRAPPC1Q9Y5R8 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
TRAPPC1Q9Y5R8 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
TRAPPC1Q9Y5R8 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
TRAPPC1Q9Y5R8 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
TRAPPC1Q9Y5R8 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
TRAPPC1Q9Y5R8 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
TRAPPC1Q9Y5R8 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
TRAPPC1Q9Y5R8 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
TRAPPC1Q9Y5R8 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
TRAPPC1Q9Y5R8 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
TRAPPC1Q9Y5R8 PML-210ENST00000563500 4502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
TRAPPC1Q9Y5R8 EPN2-202ENST00000347697 4664 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
TRAPPC1Q9Y5R8 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
TRAPPC1Q9Y5R8 PLD1-201ENST00000331659 2906 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
TRAPPC1Q9Y5R8 ATP2C1-201ENST00000328560 3484 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
TRAPPC1Q9Y5R8 SMG9-201ENST00000270066 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
TRAPPC1Q9Y5R8 BCAP29-201ENST00000005259 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
TRAPPC1Q9Y5R8 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
TRAPPC1Q9Y5R8 ZNF519-206ENST00000589498 2117 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
TRAPPC1Q9Y5R8 ALDH3A2-201ENST00000176643 3928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
TRAPPC1Q9Y5R8 GJB4-201ENST00000339480 2840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
TRAPPC1Q9Y5R8 ENG-204ENST00000480266 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
TRAPPC1Q9Y5R8 MAPK10-262ENST00000641051 5738 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
TRAPPC1Q9Y5R8 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
TRAPPC1Q9Y5R8 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
TRAPPC1Q9Y5R8 SEMA4D-212ENST00000450295 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
TRAPPC1Q9Y5R8 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
TRAPPC1Q9Y5R8 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
TRAPPC1Q9Y5R8 FBN1-201ENST00000316623 11756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
TRAPPC1Q9Y5R8 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
TRAPPC1Q9Y5R8 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
TRAPPC1Q9Y5R8 AL365181.3-201ENST00000605886 3222 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
TRAPPC1Q9Y5R8 ZC2HC1A-201ENST00000263849 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
TRAPPC1Q9Y5R8 MST1R-201ENST00000296474 4536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
TRAPPC1Q9Y5R8 CRACR2A-203ENST00000440314 2697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
TRAPPC1Q9Y5R8 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
TRAPPC1Q9Y5R8 ITGB2-201ENST00000302347 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
TRAPPC1Q9Y5R8 SIGLEC9-201ENST00000250360 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
TRAPPC1Q9Y5R8 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
TRAPPC1Q9Y5R8 RAB11FIP1-206ENST00000524118 1959 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms