Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3A2

UTP11, Probable U3 small nucleolar RNA-associated protein 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP11Q9Y3A2 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UTP11Q9Y3A2 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UTP11Q9Y3A2 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UTP11Q9Y3A2 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UTP11Q9Y3A2 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UTP11Q9Y3A2 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UTP11Q9Y3A2 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UTP11Q9Y3A2 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UTP11Q9Y3A2 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UTP11Q9Y3A2 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UTP11Q9Y3A2 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UTP11Q9Y3A2 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UTP11Q9Y3A2 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UTP11Q9Y3A2 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UTP11Q9Y3A2 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UTP11Q9Y3A2 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UTP11Q9Y3A2 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UTP11Q9Y3A2 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UTP11Q9Y3A2 RPS6KC1-201ENST00000366959 5454 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UTP11Q9Y3A2 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UTP11Q9Y3A2 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UTP11Q9Y3A2 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UTP11Q9Y3A2 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UTP11Q9Y3A2 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UTP11Q9Y3A2 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UTP11Q9Y3A2 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
UTP11Q9Y3A2 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
UTP11Q9Y3A2 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UTP11Q9Y3A2 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
UTP11Q9Y3A2 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
UTP11Q9Y3A2 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UTP11Q9Y3A2 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
UTP11Q9Y3A2 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UTP11Q9Y3A2 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
UTP11Q9Y3A2 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UTP11Q9Y3A2 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
UTP11Q9Y3A2 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UTP11Q9Y3A2 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UTP11Q9Y3A2 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UTP11Q9Y3A2 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UTP11Q9Y3A2 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
UTP11Q9Y3A2 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
UTP11Q9Y3A2 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
UTP11Q9Y3A2 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
UTP11Q9Y3A2 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UTP11Q9Y3A2 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
UTP11Q9Y3A2 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
UTP11Q9Y3A2 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
UTP11Q9Y3A2 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UTP11Q9Y3A2 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
UTP11Q9Y3A2 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
UTP11Q9Y3A2 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
UTP11Q9Y3A2 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
UTP11Q9Y3A2 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
UTP11Q9Y3A2 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
UTP11Q9Y3A2 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UTP11Q9Y3A2 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
UTP11Q9Y3A2 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UTP11Q9Y3A2 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
UTP11Q9Y3A2 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
UTP11Q9Y3A2 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
UTP11Q9Y3A2 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
UTP11Q9Y3A2 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UTP11Q9Y3A2 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
UTP11Q9Y3A2 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UTP11Q9Y3A2 BVES-201ENST00000314641 5567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UTP11Q9Y3A2 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
UTP11Q9Y3A2 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UTP11Q9Y3A2 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UTP11Q9Y3A2 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UTP11Q9Y3A2 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
UTP11Q9Y3A2 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
UTP11Q9Y3A2 RAPH1-202ENST00000319170 9808 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UTP11Q9Y3A2 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UTP11Q9Y3A2 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UTP11Q9Y3A2 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
UTP11Q9Y3A2 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
UTP11Q9Y3A2 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UTP11Q9Y3A2 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UTP11Q9Y3A2 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UTP11Q9Y3A2 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UTP11Q9Y3A2 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UTP11Q9Y3A2 ADAMTS7P1-201ENST00000613213 4793 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
UTP11Q9Y3A2 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
UTP11Q9Y3A2 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
UTP11Q9Y3A2 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
UTP11Q9Y3A2 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
UTP11Q9Y3A2 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
UTP11Q9Y3A2 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
UTP11Q9Y3A2 CCP110-203ENST00000396212 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
UTP11Q9Y3A2 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
UTP11Q9Y3A2 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
UTP11Q9Y3A2 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
UTP11Q9Y3A2 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
UTP11Q9Y3A2 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
UTP11Q9Y3A2 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
UTP11Q9Y3A2 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
UTP11Q9Y3A2 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
UTP11Q9Y3A2 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
UTP11Q9Y3A2 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91 ms