Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
COPS7AQ9UBW8 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
COPS7AQ9UBW8 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
COPS7AQ9UBW8 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
COPS7AQ9UBW8 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
COPS7AQ9UBW8 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
COPS7AQ9UBW8 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
COPS7AQ9UBW8 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
COPS7AQ9UBW8 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
COPS7AQ9UBW8 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
COPS7AQ9UBW8 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
COPS7AQ9UBW8 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
COPS7AQ9UBW8 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
COPS7AQ9UBW8 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
COPS7AQ9UBW8 TRIM25-201ENST00000316881 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
COPS7AQ9UBW8 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
COPS7AQ9UBW8 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
COPS7AQ9UBW8 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
COPS7AQ9UBW8 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
COPS7AQ9UBW8 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
COPS7AQ9UBW8 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
COPS7AQ9UBW8 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
COPS7AQ9UBW8 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
COPS7AQ9UBW8 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
COPS7AQ9UBW8 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
COPS7AQ9UBW8 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
COPS7AQ9UBW8 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
COPS7AQ9UBW8 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
COPS7AQ9UBW8 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
COPS7AQ9UBW8 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
COPS7AQ9UBW8 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
COPS7AQ9UBW8 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
COPS7AQ9UBW8 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
COPS7AQ9UBW8 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
COPS7AQ9UBW8 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
COPS7AQ9UBW8 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
COPS7AQ9UBW8 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
COPS7AQ9UBW8 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
COPS7AQ9UBW8 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
COPS7AQ9UBW8 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
COPS7AQ9UBW8 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
COPS7AQ9UBW8 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
COPS7AQ9UBW8 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
COPS7AQ9UBW8 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
COPS7AQ9UBW8 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
COPS7AQ9UBW8 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
COPS7AQ9UBW8 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
COPS7AQ9UBW8 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
COPS7AQ9UBW8 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
COPS7AQ9UBW8 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
COPS7AQ9UBW8 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC14.22□□□□□ -0.13
COPS7AQ9UBW8 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
COPS7AQ9UBW8 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
COPS7AQ9UBW8 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
COPS7AQ9UBW8 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
COPS7AQ9UBW8 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
COPS7AQ9UBW8 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
COPS7AQ9UBW8 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC14.22□□□□□ -0.13
COPS7AQ9UBW8 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
COPS7AQ9UBW8 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
COPS7AQ9UBW8 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
COPS7AQ9UBW8 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
COPS7AQ9UBW8 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC14.22□□□□□ -0.13
COPS7AQ9UBW8 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
COPS7AQ9UBW8 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
COPS7AQ9UBW8 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
COPS7AQ9UBW8 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
COPS7AQ9UBW8 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
COPS7AQ9UBW8 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
COPS7AQ9UBW8 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
COPS7AQ9UBW8 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
COPS7AQ9UBW8 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
COPS7AQ9UBW8 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
COPS7AQ9UBW8 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
COPS7AQ9UBW8 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
COPS7AQ9UBW8 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
COPS7AQ9UBW8 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
COPS7AQ9UBW8 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
COPS7AQ9UBW8 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
COPS7AQ9UBW8 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
COPS7AQ9UBW8 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
COPS7AQ9UBW8 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
COPS7AQ9UBW8 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
COPS7AQ9UBW8 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
COPS7AQ9UBW8 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
COPS7AQ9UBW8 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
COPS7AQ9UBW8 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
COPS7AQ9UBW8 CSF2RB-202ENST00000403662 4863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
COPS7AQ9UBW8 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
COPS7AQ9UBW8 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
COPS7AQ9UBW8 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
COPS7AQ9UBW8 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
COPS7AQ9UBW8 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
COPS7AQ9UBW8 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
COPS7AQ9UBW8 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
COPS7AQ9UBW8 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
COPS7AQ9UBW8 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
COPS7AQ9UBW8 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
COPS7AQ9UBW8 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
COPS7AQ9UBW8 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms