Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU2

DKK2, Dickkopf-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK2Q9UBU2 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC11.48□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC11.48□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC11.48□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC11.48□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 PDE8A-201ENST00000310298 3984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 FBXL19-201ENST00000338343 3965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 CALHM1-201ENST00000329905 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 CPXM2-201ENST00000241305 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 THTPA-201ENST00000288014 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC11.47□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 SLC20A2-208ENST00000520262 2992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
DKK2Q9UBU2 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms