Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBH6

XPR1, Xenotropic and polytropic retrovirus receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 696 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPR1Q9UBH6 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
XPR1Q9UBH6 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
XPR1Q9UBH6 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
XPR1Q9UBH6 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
XPR1Q9UBH6 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
XPR1Q9UBH6 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
XPR1Q9UBH6 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
XPR1Q9UBH6 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
XPR1Q9UBH6 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
XPR1Q9UBH6 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
XPR1Q9UBH6 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
XPR1Q9UBH6 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
XPR1Q9UBH6 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
XPR1Q9UBH6 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
XPR1Q9UBH6 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
XPR1Q9UBH6 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
XPR1Q9UBH6 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
XPR1Q9UBH6 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
XPR1Q9UBH6 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
XPR1Q9UBH6 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
XPR1Q9UBH6 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
XPR1Q9UBH6 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
XPR1Q9UBH6 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
XPR1Q9UBH6 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
XPR1Q9UBH6 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
XPR1Q9UBH6 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
XPR1Q9UBH6 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
XPR1Q9UBH6 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
XPR1Q9UBH6 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
XPR1Q9UBH6 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
XPR1Q9UBH6 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
XPR1Q9UBH6 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
XPR1Q9UBH6 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
XPR1Q9UBH6 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
XPR1Q9UBH6 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
XPR1Q9UBH6 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
XPR1Q9UBH6 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
XPR1Q9UBH6 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
XPR1Q9UBH6 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
XPR1Q9UBH6 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
XPR1Q9UBH6 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
XPR1Q9UBH6 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
XPR1Q9UBH6 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
XPR1Q9UBH6 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
XPR1Q9UBH6 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
XPR1Q9UBH6 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
XPR1Q9UBH6 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
XPR1Q9UBH6 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
XPR1Q9UBH6 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
XPR1Q9UBH6 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
XPR1Q9UBH6 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
XPR1Q9UBH6 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
XPR1Q9UBH6 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
XPR1Q9UBH6 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
XPR1Q9UBH6 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
XPR1Q9UBH6 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
XPR1Q9UBH6 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
XPR1Q9UBH6 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
XPR1Q9UBH6 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC15.08■□□□□ 0
XPR1Q9UBH6 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
XPR1Q9UBH6 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC15.08■□□□□ 0
XPR1Q9UBH6 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
XPR1Q9UBH6 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
XPR1Q9UBH6 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
XPR1Q9UBH6 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
XPR1Q9UBH6 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
XPR1Q9UBH6 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC15.08■□□□□ 0
XPR1Q9UBH6 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
XPR1Q9UBH6 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
XPR1Q9UBH6 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
XPR1Q9UBH6 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
XPR1Q9UBH6 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
XPR1Q9UBH6 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
XPR1Q9UBH6 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
XPR1Q9UBH6 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
XPR1Q9UBH6 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
XPR1Q9UBH6 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
XPR1Q9UBH6 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
XPR1Q9UBH6 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
XPR1Q9UBH6 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
XPR1Q9UBH6 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
XPR1Q9UBH6 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
XPR1Q9UBH6 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
XPR1Q9UBH6 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
XPR1Q9UBH6 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
XPR1Q9UBH6 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
XPR1Q9UBH6 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
XPR1Q9UBH6 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
XPR1Q9UBH6 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
XPR1Q9UBH6 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
XPR1Q9UBH6 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
XPR1Q9UBH6 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
XPR1Q9UBH6 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
XPR1Q9UBH6 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
XPR1Q9UBH6 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
XPR1Q9UBH6 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
XPR1Q9UBH6 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
XPR1Q9UBH6 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
XPR1Q9UBH6 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
XPR1Q9UBH6 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms