Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2R6

RERE, Arginine-glutamic acid dipeptide repeats protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,566 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REREQ9P2R6 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
REREQ9P2R6 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
REREQ9P2R6 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
REREQ9P2R6 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
REREQ9P2R6 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
REREQ9P2R6 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
REREQ9P2R6 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
REREQ9P2R6 LAIR1-209ENST00000434277 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
REREQ9P2R6 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
REREQ9P2R6 RNVU1-8-201ENST00000364272 125 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
REREQ9P2R6 CDKN2C-202ENST00000371761 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
REREQ9P2R6 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
REREQ9P2R6 AC098934.1-203ENST00000442868 1262 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
REREQ9P2R6 AL121845.1-201ENST00000447343 464 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
REREQ9P2R6 RPL9-203ENST00000449470 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
REREQ9P2R6 AC226150.1-201ENST00000544259 466 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
REREQ9P2R6 MT2A-202ENST00000561491 581 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
REREQ9P2R6 AC006548.2-201ENST00000605217 529 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
REREQ9P2R6 AL138720.1-201ENST00000629853 778 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
REREQ9P2R6 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
REREQ9P2R6 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
REREQ9P2R6 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
REREQ9P2R6 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
REREQ9P2R6 EMP1-211ENST00000544053 1436 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
REREQ9P2R6 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
REREQ9P2R6 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
REREQ9P2R6 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
REREQ9P2R6 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
REREQ9P2R6 TMEM222-204ENST00000466759 368 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
REREQ9P2R6 CD164-210ENST00000512821 964 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
REREQ9P2R6 TPM1-220ENST00000559556 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
REREQ9P2R6 AC010632.2-201ENST00000588369 1224 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
REREQ9P2R6 OCEL1-206ENST00000597836 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
REREQ9P2R6 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
REREQ9P2R6 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
REREQ9P2R6 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
REREQ9P2R6 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
REREQ9P2R6 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
REREQ9P2R6 CXorf40A-205ENST00000423540 1208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
REREQ9P2R6 AL391415.1-201ENST00000439844 400 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
REREQ9P2R6 AL355376.1-201ENST00000456082 517 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
REREQ9P2R6 AC005845.1-201ENST00000539206 653 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
REREQ9P2R6 NAA40-205ENST00000539656 577 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
REREQ9P2R6 ABHD17AP9-201ENST00000561925 548 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
REREQ9P2R6 IGHV3OR16-12-201ENST00000570121 353 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
REREQ9P2R6 AL139339.2-201ENST00000608063 657 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
REREQ9P2R6 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
REREQ9P2R6 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
REREQ9P2R6 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
REREQ9P2R6 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
REREQ9P2R6 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
REREQ9P2R6 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
REREQ9P2R6 GPD1-205ENST00000548814 1591 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
REREQ9P2R6 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
REREQ9P2R6 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
REREQ9P2R6 UPK1A-203ENST00000616789 1366 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
REREQ9P2R6 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
REREQ9P2R6 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
REREQ9P2R6 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
REREQ9P2R6 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
REREQ9P2R6 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
REREQ9P2R6 MS4A15-201ENST00000337911 1536 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
REREQ9P2R6 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
REREQ9P2R6 BABAM2-204ENST00000379624 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
REREQ9P2R6 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
REREQ9P2R6 IQCJ-201ENST00000397832 1460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
REREQ9P2R6 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
REREQ9P2R6 HIST1H2BJ-201ENST00000339812 381 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
REREQ9P2R6 LINC01022-201ENST00000415652 394 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
REREQ9P2R6 AC083801.1-201ENST00000491689 358 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
REREQ9P2R6 DUXAP9-201ENST00000547220 665 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
REREQ9P2R6 AC090001.1-201ENST00000553194 467 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
REREQ9P2R6 CYP4F36P-201ENST00000589193 186 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
REREQ9P2R6 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
REREQ9P2R6 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
REREQ9P2R6 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
REREQ9P2R6 SLC25A3-216ENST00000551917 1359 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
REREQ9P2R6 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
REREQ9P2R6 BSDC1-205ENST00000446293 1505 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
REREQ9P2R6 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
REREQ9P2R6 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
REREQ9P2R6 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
REREQ9P2R6 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
REREQ9P2R6 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
REREQ9P2R6 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
REREQ9P2R6 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
REREQ9P2R6 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
REREQ9P2R6 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
REREQ9P2R6 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
REREQ9P2R6 CRHR1-205ENST00000352855 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
REREQ9P2R6 MAPK13-202ENST00000373759 1036 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
REREQ9P2R6 ATF4-202ENST00000396680 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
REREQ9P2R6 GULP1-204ENST00000409637 1242 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
REREQ9P2R6 SIX3-AS1-202ENST00000456467 557 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
REREQ9P2R6 AL353150.1-201ENST00000456944 583 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
REREQ9P2R6 POLR2J3-217ENST00000513438 546 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
REREQ9P2R6 AC109479.3-201ENST00000520163 360 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
REREQ9P2R6 CYB561A3-208ENST00000536915 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
REREQ9P2R6 AC009779.3-204ENST00000549424 367 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
REREQ9P2R6 AC023421.2-201ENST00000589510 313 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
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